当前解析结果
SmilChr07G000366| 统一基因 ID | SmilChr07G000366 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000366 |
| 描述 | endo-1,3;1,4-beta-D-glucanase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2506116 - 2508531 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991567 |
|---|---|
| GeneID | 130991567 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130991567 |
| 原始查询 | SmilChr07G000366 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | endo-1,3;1,4-beta-D-glucanase-like |
| 产物 | endo-1%2C3%3B1%2C4-beta-D-glucanase-like |
| 拟南芥 | AT3G23600 (AT3G23600)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821939] identity=61.09; qcov=1.0; evalue=1.03e-103; confidence=high |
| 水稻 | Os05g0399100- identity=55.83; qcov=1.0; evalue=7.15e-93; confidence=high |
| GO | GO:0016787 (hydrolase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01738 (DLH) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991567 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057771838.1 |
| 2 | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771838.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2506321 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B107,B113,B130,B139,B72,C18,C28,C83 |
Chr7:2506334 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C46 |
Chr7:2507301 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
Chr7:2507325 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr7:2507332 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,C15 |
Chr7:2507344 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,A6,B87,B95,C27 |
Chr7:2507518 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr7:2507671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr7:2507695 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:2507954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B69,C38,C86 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771838.1PF01738
DLH 30-234 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771838.1 |
Pfam | PF01738 |
DLH | Domain | 30 | 234 | 7.7e-27 | 95.0 | Dienelactone hydrolase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。