当前解析结果
SmilChr07G000379| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000379 |
| 描述 | BI1-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2562033 - 2564086 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991581 |
|---|---|
| GeneID | 130991581 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991581 |
| 原始查询 | SmilChr07G000379 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BI1-like protein |
| 产物 | BI1-like protein |
| Arabidopsis | AT4G15470 (AT4G15470)Bax inhibitor-1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827218] identity=68.4; qcov=1.01; evalue=5.67e-120; confidence=high |
| Rice | Os05g0402300- identity=59; qcov=0.936; evalue=5.5e-100; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01027 (Bax1-I) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991581 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057771853.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.60000 | XP_057771853.1 |
| 3 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.40000 | XP_057771853.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.40000 | XP_057771853.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771853.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2562261 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B104,C48 |
Chr7:2562288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr7:2563256 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B48,B66,C11,C69 |
Chr7:2563261 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A5 |
Chr7:2563261 |
T |
TTC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr7:2563313 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr7:2563322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr7:2563471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B8,C55 |
Chr7:2563477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,B8,C55 |
Chr7:2563743 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B19,B41,C10,C43,C9 |
Chr7:2563754 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr7:2563772 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,C41 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771853.1PF01027
Bax1-I 41-248 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771853.1 |
Pfam | PF01027 |
Bax1-I | Domain | 41 | 248 | 1.2e-48 | 166.4 | Inhibitor of apoptosis-promoting Bax1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。