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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000386`

染色体: Chr07 坐标: 2588549-2590141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000386`
名称	SmilChr07G000386
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At4g00320
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2588549 - 2590141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991586`
GeneID	`130991586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991586`
原始查询	`SmilChr07G000386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At4g00320
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At4g00320
Arabidopsis	`AT4G00320` (AT4G00320) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827939] identity=27.9; qcov=0.674; evalue=5.89e-14; confidence=low
Rice	`Os05g0575400` (OsFbox283) - identity=27.3; qcov=0.523; evalue=3.52e-07; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771859.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771859.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771859.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771859.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2588614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr7:2588633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:2588648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B24,B33
`Chr7:2588706`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A21,B40
`Chr7:2588706`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A21,B40
`Chr7:2588707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B10,B36,B67
`Chr7:2588725`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A10,A14,A23,A5,A6,A9,B101,B108,B122,B129,B16,B19,B20,B26,B32,B33,B47,B48,B5,B50,B54,B56,B57,B62,B63,B64,B66,B74,B80,B87,B89,B91,B94,B96,B99,C14,C19,C2,C23,C32,C33,C35,C36,C4,C44,C49,C50,C51,C73,C8,C81
`Chr7:2588783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B24,B33
`Chr7:2588956`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr7:2588983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr7:2589033`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,A2,B105,B108,B131,B4,C60,C77,D2
`Chr7:2589034`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A25,B111,B113,B132,B29,B30,C1,C12,C16,C17,C20,C26,C31,C34,C52,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771859.1

442 aa

221

442

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 118-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771859.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	118	193	1.7e-12	48.3	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915876.1
TGCAAGTCTTCCTCCCATGGAGAATGCTCAGAAAAGAATTGCGGCCGATGGCGAATCCAAACTTCCAGAGGAAATCATTCAGCACATACAATCACTTATGTCTGAAAGGGATGCTGCTCTAACCACTCTCCTATCCAAGTCGTGGCACGGCGCGTGGTGCACACGCCCCAACCTCTATTTCGATCCACTCCCGTTTCGGCATCGCATGGATGAGTTCCCCATATTCGCGAGGAAGTCCATGCAGAGGTACGAAGATCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991586
ATGGAGAATGCTCAGAAAAGAATTGCGGCCGATGGCGAATCCAAACTTCCAGAGGAAATCATTCAGCACATACAATCACTTATGTCTGAAAGGGATGCTGCTCTAACCACTCTCCTATCCAAGTCGTGGCACGGCGCGTGGTGCACACGCCCCAACCTCTATTTCGATCCACTCCCGTTTCGGCATCGCATGGATGAGTTCCCCATATTCGCGAGGAAGTCCATGCAGAGGTACGAAGATCTGAACCTAAAGATTAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771859.1
MENAQKRIAADGESKLPEEIIQHIQSLMSERDAALTTLLSKSWHGAWCTRPNLYFDPLPFRHRMDEFPIFARKSMQRYEDLNLKIKSFKLWVEGDDDSDLARELILKAIKLGATDLTIDVPTWVSINLPYEVLESETLTRLSVHNVRVDFRKSNKVVNSSNLKSLHLSNEHVNGDLIRNLISRCPSIEELTLRRLGRSTLPVYEDPMIDLHKLIQLHKLKYLRLDSLGIADRSKRDLWPQFACLKELVIWDYLVFDHSDW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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