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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000396`

染色体: Chr07 坐标: 2736649-2737655 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000396`
名称	SmilChr07G000396
描述	uncharacterized SmilChr07G000396
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2736649 - 2737655 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991592`
GeneID	`130991592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991592`
原始查询	`SmilChr07G000396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L33 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831997]; symbol=AT5G18790; hit=AT5G18790; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L33 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831997]; symbol=AT5G18790; hit=AT5G18790; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G18790` (AT5G18790) Ribosomal protein L33 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831997] identity=69.4; qcov=1.03; evalue=1.06e-21; confidence=medium
Rice	`Os05g0452600` - identity=68.3; qcov=1; evalue=3.72e-21; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015934 (large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00471 (Ribosomal_L33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771865.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057771865.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057771865.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771865.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2736818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771865.1

60 aa

Ribosomal_L33

PF00471 Ribosomal_L33 12-58 aa

XP_057771866.1

60 aa

Ribosomal_L33

PF00471 Ribosomal_L33 12-58 aa

XP_057771867.1

60 aa

Ribosomal_L33

PF00471 Ribosomal_L33 12-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771865.1`	Pfam	`PF00471`	Ribosomal_L33	Family	12	58	7.2e-11	43.0	Ribosomal protein L33
`XP_057771866.1`	Pfam	`PF00471`	Ribosomal_L33	Family	12	58	7.2e-11	43.0	Ribosomal protein L33
`XP_057771867.1`	Pfam	`PF00471`	Ribosomal_L33	Family	12	58	7.2e-11	43.0	Ribosomal protein L33

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915882.1
ATTACTAGTTCATAATGGGCTTGGGAGTGGGCCAGCTGCCCAGCCCAGCCCAGTAAAGATCCCCTTGGCCCTTGATTTATGAGTCCACGTTTCAGCTTCTCTTGCTGATCAGTGTCGAAGCCGGCGCCGCCGTCTCTGTTGCTAAATACGTCTGGTTTTGAGTTGTGAAAATGGGCGAGAAGAAGAAGGGAGGTGCTATGTTGGTTCGGCTTGTGTCGGCAGCTGGAACCGGATTCTTCTATGTCGTGAAGAAGACGAAG...

XM_057915884.1
TCTCTGTTGCTAAATACGGTAATCTTCCTTTAGTTTTCCGATTGATTCAGAGCAGGAACTCTTTTGAACAAGGAGAAGCTTTTTCAGCTCAATAGCGCAACTATTGAAGAGATAACTTCCAACGAATCAATCAGAATTGAGACAGGAAGTAATGTCGAAAGCGAGATTTTGGAGCCTGCTAACCCTCGCTTCAAATTTGTTTGTTAATTTCGCCTTCAATTTTTCCAAGTTCCTTTACATCGAAATTAAATGCTACACCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991592
ATGGGCGAGAAGAAGAAGGGAGGTGCTATGTTGGTTCGGCTTGTGTCGGCAGCTGGAACCGGATTCTTCTATGTCGTGAAGAAGACGAAGAGGCTCCACACCAACAATATCAAGCTGGAGTTCCGCAAGTATGATCCTCGCGTCAATCGCCATGTTTTGTTCACGGAGGCAAAGATGAAGTGA

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771865.1
MGEKKKGGAMLVRLVSAAGTGFFYVVKKTKRLHTNNIKLEFRKYDPRVNRHVLFTEAKMK

XP_057771866.1
MGEKKKGGAMLVRLVSAAGTGFFYVVKKTKRLHTNNIKLEFRKYDPRVNRHVLFTEAKMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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