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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000397`

染色体: Chr07 坐标: 2741719-2747399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000397`
名称	SmilChr07G000397
描述	squamosa promoter-binding-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2741719 - 2747399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991594`
GeneID	`130991594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991594`
原始查询	`SmilChr07G000397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 7
产物	squamosa promoter-binding-like protein 7
Arabidopsis	`AT5G18830` (SPL7) squamosa promoter binding protein-like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832001] identity=44.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os05g0408200` (OsSPL9) - identity=36.9; qcov=1.1; evalue=7.16e-162; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP); PF26102 (Ig_SPL7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771870.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771870.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771870.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771870.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771870.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2742229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:2742246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr7:2742267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:2742297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:2742381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B91
`Chr7:2742387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:2743904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:2743949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:2743966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C78,C85
`Chr7:2744028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:2744081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr7:2744093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B120,B91,C62,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771870.1

774 aa

387

774

SBP

Ig_SPL7

PF03110 SBP 125-199 aa PF26102 Ig_SPL7 412-523 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771870.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	125	199	1.1e-28	100.1	SBP domain
`XP_057771870.1`	Pfam	`PF26102`	Ig_SPL7	Domain	412	523	2.8e-35	121.6	SPL7-like, immunoglobulin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915887.1
CCATGATTTAGTATCTTTTAATTAATGCCCCTTCTTGTAAACACACAACAATGTCAAATACACCAGAAAAATATGCTATGGAAAATCTCTCAAATAATGAGTGTAGAGAGATTGTATTTTGCAGCTACAGTTTTCTTTTCTCAGACAATAAAGGTCTTCAGTTAACCACCTACATACCTACCGCCACCACCTGCAAACTCTCTCTCTCTCTCCCCAACCAAGTCCACCCTTAAATCATAGATAAGTCATCAAGATCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991594
ATGGAGCACAATTCGCCGCCGCCGATCCCTAGCCCAGTCTACCTGCCATCGGCCGCCGCCGACCCGGCCGAATCGGCCCTCTTCGACTGGTCCGACTTCCTCGATTTCGACATCGACGAAGCCCTCAACACCCCCTTCGCCATCTCCGAGCCCGGGTCGGGGCCGGAGCAGGAGCTCGGATCCGACCAGTCGGAGAATCTGGGCCGGGTCAGGAAGCGGGACCCGAGACTGCTGTGCCCCAATTTCGTGGCGGGTGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771870.1
MEHNSPPPIPSPVYLPSAAADPAESALFDWSDFLDFDIDEALNTPFAISEPGSGPEQELGSDQSENLGRVRKRDPRLLCPNFVAGVVPCACPELDKKLEEEEESALPGKKRTRALRAPAAGPLLCQVPGCEADISELKGYHKRHRVCLKCAHAAVVVLDGESKRYCQQCGKFHLLSNFDEGKRSCRRKLEKHNDRRRRKSNGSKGGTDKEPHQVVLVDDVKEDDDGGKDGTSPSSQIEEKEMLLKSDGHVSAVSSGPDSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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