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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000418`

染色体: Chr07 坐标: 2884906-2886675 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000418`
名称	SmilChr07G000418
描述	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2884906 - 2886675 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991614`
GeneID	`130991614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991614`
原始查询	`SmilChr07G000418`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 4
产物	S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 4
Arabidopsis	`AT5G18930` (BUD2) Adenosylmethionine decarboxylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832011] identity=59.4; qcov=1.04; evalue=2.58e-137; confidence=high
Rice	`Os05g0141800` (OsSAMDC3) - identity=50.3; qcov=1.04; evalue=2.76e-95; confidence=high
GO	GO:0004014 (adenosylmethionine decarboxylase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006597 (spermine biosynthetic process); GO:0008295 (spermidine biosynthetic process)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01536 (SAM_decarbox)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771905.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771905.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771905.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771905.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2885469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:2885565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D1
`Chr7:2885568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr7:2885572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:2885751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C63
`Chr7:2885808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C63
`Chr7:2885817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:2885841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:2885842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:2885922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C63
`Chr7:2885923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:2886267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771905.1

338 aa

169

338

SAM_decarbox

PF01536 SAM_decarbox 5-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771905.1`	Pfam	`PF01536`	SAM_decarbox	Family	5	333	2.6e-101	339.9	Adenosylmethionine decarboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915922.1
GCAATCATTCTCTTTTGGTTGCCTCACCCGCATGACCCCCTCTTCACTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCACACCCCCCCTTACTATATATATGTATATATATATACTCACTCTCCTGTACCACTCCATCACACCTCTCATCTCCCTCTCACACACTACTACACACACTAAACCTTCTTCAAATCACACTATCAAATTTTTTCTTTGATCAAACACATCAAAAAACAAAATCCACAACAAATCTCCCGATCCAATGGCGGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991614
ATGGCGGTGTCCGGGTTCGAAGGGTTCGAGAAGAGGCTCGAGCTCCGCTTCTCCGGCGACGATCCGGCCGCCGGAGGGCACGGGCTCCGGCGGCTGGAGTTCTGCAAGCTGGAGAAAGTGCTGCATGCGGTGCAGTGCACCGTGGTGTCGGCGGTGGGGAACACGCGCTTCGACTCGTACGTTTTGTCGGAGTCGAGCCTGTTCGTGTACCCCACGAGGATCATCATCAAGACATGTGGGACCACGCACCTGCTCAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771905.1
MAVSGFEGFEKRLELRFSGDDPAAGGHGLRRLEFCKLEKVLHAVQCTVVSAVGNTRFDSYVLSESSLFVYPTRIIIKTCGTTHLLKSVRPLVDHAATLGLTLCGCRYTRGTFIFPDAQPYPHTTFKEEVLYLEENLPKNLSLRKAAVMGSKSCYKWHVFTACDDDAPAEEGGDGLFTVEICMTELDRVLAKNFFRRFNDGKTGDSAGVEMTDVTGIRSVNRNALICDYAFDPCGYSMNGVDGGRYSTVHVTPEDGFSYAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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