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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000426`

染色体: Chr07 坐标: 2966810-2968301 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000426`
名称	SmilChr07G000426
描述	uncharacterized SmilChr07G000426
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2966810 - 2968301 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991621`
GeneID	`130991621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991621`
原始查询	`SmilChr07G000426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827939]; symbol=AT4G00320; hit=AT4G00320; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827939]; symbol=AT4G00320; hit=AT4G00320; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00320` (AT4G00320) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827939] identity=31.9; qcov=0.464; evalue=1.88e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07723 (LRR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771912.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771912.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771912.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771912.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2966917`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A22,A3,B1,B104,B106,B132,B2,B21,B35,B41,B42,B43,B45,B47,B58,B6,B62,B71,B83,B87,C10,C12,C29,C31,C33,C41,C46,C51,C52,C59,C67,C83,C9,D1
`Chr7:2966978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B138,B89
`Chr7:2967000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:2967059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C10
`Chr7:2967123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B104,B76,C60
`Chr7:2967138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:2967181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A5,C58
`Chr7:2967204`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B8,B95,C74,C87
`Chr7:2967204`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B8,B95,C74,C87
`Chr7:2967238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B104,C34,C60,D6
`Chr7:2967255`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,A14,A19,A24,A5,A7,B13,B26,B54,B55,B64,B85,C23,C51,C72,C8,C81,C86,D2
`Chr7:2967259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771912.1

459 aa

230

459

LRR_2

PF07723 LRR_2 155-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771912.1`	Pfam	`PF07723`	LRR_2	Repeat	155	179	8.1e-05	23.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915929.1
TTGCAGTCGTGTCTTGATATGGAAAAGTGCAAGAGAATCGAAACTCGATTGCTGCCGGAAGCCATGATTCAGCAGATACAGTCTTTTTTGAGTGAAAAAGAAGCTGCTCGAACCACTCTTGTCTCCAAATCATGGTACAACGCGTGGCTAACTCGTCCCGTGCTCGTGCTCGTGCTCAGAAATCTCCATCGGAAATCATCGGCGGCCGAGTGCTCGAACTTAGCAATGAAGGCCATGCGAAGGTATCATGACGCGAACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991621
ATGGAAAAGTGCAAGAGAATCGAAACTCGATTGCTGCCGGAAGCCATGATTCAGCAGATACAGTCTTTTTTGAGTGAAAAAGAAGCTGCTCGAACCACTCTTGTCTCCAAATCATGGTACAACGCGTGGCTAACTCGTCCCGTGCTCGTGCTCGTGCTCAGAAATCTCCATCGGAAATCATCGGCGGCCGAGTGCTCGAACTTAGCAATGAAGGCCATGCGAAGGTATCATGACGCGAACTTGAAGATCGAGAGTTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771912.1
MEKCKRIETRLLPEAMIQQIQSFLSEKEAARTTLVSKSWYNAWLTRPVLVLVLRNLHRKSSAAECSNLAMKAMRRYHDANLKIESLSLKMRGCRNSSEPLARKLIADAMKLGATDLKLEFFPSGFALPAEVLGSETLRRLSVSGCQIDGNVNCSMLKSLSLDSVLFKREDDMLRIITSCCNSIEELSLSNSPIVNYITELRWQNLHEFHKLKRLYLERVTVRNSFTYLESQCPCLEDLSLVHCYNTGIHITSSSLKRISI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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