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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000431`

染色体: Chr07 坐标: 3011805-3013280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000431`
名称	SmilChr07G000431
描述	uncharacterized SmilChr07G000431
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3011805 - 3013280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991625`
GeneID	`130991625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991625`
原始查询	`SmilChr07G000431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824076]; symbol=AT3G49150; hit=AT3G49150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824076]; symbol=AT3G49150; hit=AT3G49150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G49150` (AT3G49150) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824076] identity=29.4; qcov=0.443; evalue=1.28e-11; confidence=low
Rice	`Os08g0197500` (OsFbox425) - identity=26.4; qcov=0.419; evalue=1.46e-06; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07723 (LRR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771920.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771920.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771920.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771920.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3011911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B16,B61,D11
`Chr7:3011914`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr7:3011914`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr7:3011917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C27,C31,C38
`Chr7:3011933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B34,B51
`Chr7:3011936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:3011944`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115
`Chr7:3011944`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B115
`Chr7:3012025`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A10,A18,A2,A5,A6,A7,A9,B102,B104,B113,B118,B12,B126,B13,B130,B131,B139,B140,B19,B22,B29,B37,B41,B44,B5,B50,B53,B55,B61,B68,B78,B81,B85,B89,B90,B92,B95,B98,C10,C11,C31,C36,C38,C44,C45,C48,C51,C53,C58,C6,C64,C66,C69,C72,C73,C8,C9,D7
`Chr7:3012340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:3012349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3012363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771920.1

461 aa

230

461

LRR_2

PF07723 LRR_2 156-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771920.1`	Pfam	`PF07723`	LRR_2	Repeat	156	180	3.1e-05	25.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915937.1
GATGGTCGATTTTGTATTTCTTAGTTAAAGCTTGCCGTTGTTGTGTGTTGAAATGGAAAAGAGAAAGAGGAAATGTATCGAAACCCGATTGCCGGAAGCTATAATACACATAATACAGTCTTTTTTGAGTGATGAAGAAGCTGCTCGAACCACTGTTATTTCCAAATCATGGTATAAAGCCTGGCTTACTCGTCCCGCCCTCGTGCTCGTGCTCAGAAATCTCCGTCGGAAATCATCGGCGGCCGAGTTCTCGAAATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991625
ATGGAAAAGAGAAAGAGGAAATGTATCGAAACCCGATTGCCGGAAGCTATAATACACATAATACAGTCTTTTTTGAGTGATGAAGAAGCTGCTCGAACCACTGTTATTTCCAAATCATGGTATAAAGCCTGGCTTACTCGTCCCGCCCTCGTGCTCGTGCTCAGAAATCTCCGTCGGAAATCATCGGCGGCCGAGTTCTCGAAATTTGCAGCGAAGACCATGCGAAGGTATCAAGACTCCAACTTGAAGATCGAGAGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771920.1
MEKRKRKCIETRLPEAIIHIIQSFLSDEEAARTTVISKSWYKAWLTRPALVLVLRNLRRKSSAAEFSKFAAKTMRRYQDSNLKIESLSLKMRGCRRSSEPLARKLIADAMKLGATDLKLEFFPTGFALPAEVLGSETLLRLSVSGCKIDGNVNCSMLKSLSLDSVLLKREDMLRILTSCCNSIEELSLSNSPIVNYIIELRWQNLHEFHKLKRLYLERVPVGNSLTYLESQCPCLEDLSLVHCYNTGIHVKSSSLQRISI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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