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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000434`

染色体: Chr07 坐标: 3043084-3045149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000434`
名称	SmilChr07G000434
描述	peroxidase 24-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3043084 - 3045149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991628`
GeneID	`130991628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991628`
原始查询	`SmilChr07G000434`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 24-like
产物	peroxidase 24-like
Arabidopsis	`AT2G39040` (AT2G39040) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818490] identity=57.7; qcov=0.948; evalue=3.68e-120; confidence=high
Rice	`Os06g0681600` (prx89) - identity=54.8; qcov=0.941; evalue=2.12e-114; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057771922.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057771922.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3043380`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B46,B7
`Chr7:3043380`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B46,B7
`Chr7:3043399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:3043451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B99,C25,C87
`Chr7:3043520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B44
`Chr7:3043553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B75,C54
`Chr7:3043637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B50
`Chr7:3044088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr7:3044113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:3044124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A5,B139,B89,C58
`Chr7:3044428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B99,C25,C87
`Chr7:3044436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B118,B51,C27,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771922.1

324 aa

162

324

peroxidase

PF00141 peroxidase 49-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771922.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	49	286	2.7e-81	273.6	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915939.1
GGCTTAGGTGTATGCAAAACCATATTTTATGATCGTTCGTTGAGAACTTGGTGTAAACGCAATATAATCATTTGATCGCTACTCTTTTATTGATCACAAAGAAATATGGTTTGGTTTTTAAGGTTCAATTGTTTGTATCTAGGATTAGAAAATCCATTTCTTAATTACAACTTTGGAATTGGTTCTTGCCTACAATTTTTTTTATATAAACGGCCTAGCTCTTGATTAAAAAAATGTGTACCCACGTACAAAAATACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991628
ATGGAAAATTTCAAAATTTCATACACAGCGTTCTTGTTTTGTTTTTTGACATTGGAGTTATGCAATTGTGGGGATTTAAGGAAGAACTTTTATCGTACGAGCTGTCCTCAGGCAGAGAAAATCGTGCGAAACATAACTTGGGAAAATGCAGCAAGCAATGCTGCATTGCCTTCTAAAATCCTTAGGATGCATTTCCATGACTGCTTTGTTAGGGGCTGTGATGCCTCGATTTTGATAGACTCGACTACGAATAACACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771922.1
MENFKISYTAFLFCFLTLELCNCGDLRKNFYRTSCPQAEKIVRNITWENAASNAALPSKILRMHFHDCFVRGCDASILIDSTTNNTAEKDAIPNRSLAGFEVIDEIKTQLEQICPGKVSCADIVTLAARDSVSFQFNKSMWEVLTGRRDGTVSLASEALADIPSPFLNFTTLKQSFATKNLTVKDLVVLSGAHTIGVAHCNLFSNRLYNFTGKGDADPSLNATYAATLRSQCRSLSDNTTTVEMDPGSSLAFDNGYFSTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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