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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000438`

染色体: Chr07 坐标: 3061524-3065691 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000438`
名称	SmilChr07G000438
描述	uncharacterized SmilChr07G000438
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3061524 - 3065691 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991630`
GeneID	`130991630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991630`
原始查询	`SmilChr07G000438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819807]; symbol=AT3G06330; hit=AT3G06330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819807]; symbol=AT3G06330; hit=AT3G06330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G06330` (AT3G06330) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819807] identity=48.1; qcov=1.03; evalue=4.94e-103; confidence=high
Rice	`Os02g0165000` - identity=36.4; qcov=1.05; evalue=6.26e-71; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771926.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057771925.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057771925.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057771925.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057771925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3061819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:3062698`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B10,B131,B64,D1
`Chr7:3062698`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B10,B131,B64,D1
`Chr7:3063000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:3063001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:3063018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:3063123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:3063629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:3063684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C30
`Chr7:3063702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B61,C87
`Chr7:3064084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:3064091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C11,C60,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771925.1

404 aa

202

404

RINGv

PF12906 RINGv 201-247 aa

XP_057771926.1

380 aa

190

380

RINGv

PF12906 RINGv 177-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771925.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	201	247	9.7e-14	52.0	RING-variant domain
`XP_057771926.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	177	223	9e-14	52.1	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915942.1
AAATAATATTATTGAATAAATCCCGTAAATTCCAAAACCTGTTCGAAGACGAAAACCCATGGACTGTGACGTGGGCCCACCCAACTCACGTCACCACATACACCTTGTATTCATTCTCCTCTAAAGAAATTCTTGATCCTACAAAATTTTCCAGGAAAAAATAAAAGGTTGATTCTTGGGAGAAAAATTGGATCTTTTTCGGTGAAAGTCTACATTTTTCCGTTCAAGTATGGAAAATTCAGGAGCTGGTGGTGAGGTGA...

XM_057915943.1
GTAAATTCCAAAACCTGTTCGAAGACGAAAACCCATGGACTGTGACGTGGGCCCACCCAACTCACGTCACCACATACACCTTGTATTCATTCTCCTCTAAAGAAATTCTTGATCCTACAAAATTTTCCAGGAAAAAATAAAAGGTTGATTCTTGGGAGAAAAATTGGATCTTTTTCGGTGAAAGTCTACATTTTTCCGTTCAAGTATGGAAAATTCAGGAGCTGGTGGTGAGGTGAATAAAGAAGCAGCTGATTATCATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991630
ATGGAAAATTCAGGAGCTGGTGGTGAGGTGAATAAAGAAGCAGCTGATTATCATGTAACGCAGAGCCGTTCAAGATTAGAATCAGAGGCTGAATCTGTTGGTAGAATGTCCACAAATACGGCTGCTAATCCAGAGCCAAGTACACTGCCTACAGATCTAACTCTTCAAATACCCCCAAGGCCGGGGAATTTCTCAAAAAGTCGCAGTGGCAAGGGCTTCCTTCAGTCGATCAGCTTTAAAAAGATGAAAGCTGTTTCGGA...

LOC130991630
ATGACAATTTTTGATGCTGAATCTGTTGGTAGAATGTCCACAAATACGGCTGCTAATCCAGAGCCAAGTACACTGCCTACAGATCTAACTCTTCAAATACCCCCAAGGCCGGGGAATTTCTCAAAAAGTCGCAGTGGCAAGGGCTTCCTTCAGTCGATCAGCTTTAAAAAGATGAAAGCTGTTTCGGAGGGTGAAAGAAGCTCTCTTCTCAGTTCAGATTCTAAGGCACCTCCCCCAGGAAGCCCCACCTTTTCAGATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771925.1
MENSGAGGEVNKEAADYHVTQSRSRLESEAESVGRMSTNTAANPEPSTLPTDLTLQIPPRPGNFSKSRSGKGFLQSISFKKMKAVSEGERSSLLSSDSKAPPPGSPTFSDISPWPKCASVPVTPASYLSPRTLSERQRTHEAAARVAVSRSLSVPGRRSYFIVRSLSLNSCENQASNSNSDQLSPASVHDDQEIPEEEAVCRICFDTCEERNTLKMECLCKGALKLVHRECAIKWFRIRGNRNCDVCGNEVANLPVTLLR...

XP_057771926.1
MTIFDAESVGRMSTNTAANPEPSTLPTDLTLQIPPRPGNFSKSRSGKGFLQSISFKKMKAVSEGERSSLLSSDSKAPPPGSPTFSDISPWPKCASVPVTPASYLSPRTLSERQRTHEAAARVAVSRSLSVPGRRSYFIVRSLSLNSCENQASNSNSDQLSPASVHDDQEIPEEEAVCRICFDTCEERNTLKMECLCKGALKLVHRECAIKWFRIRGNRNCDVCGNEVANLPVTLLRVAPPAQRDTGELSTQQSISAWQDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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