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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000442`

染色体: Chr07 坐标: 3089603-3092796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000442`
名称	SmilChr07G000442
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3089603 - 3092796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991634`
GeneID	`130991634`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991634`
原始查询	`SmilChr07G000442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31-like
Arabidopsis	`AT5G19910` (MED31) SOH1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832113] identity=57.3; qcov=0.747; evalue=9.14e-33; confidence=medium
Rice	`Os07g0164600` (OsMED31a) - identity=49.6; qcov=0.825; evalue=6.88e-31; confidence=medium
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex); GO:0070847 (core mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF05669 (Med31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991634

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771931.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771932.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771931.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3089808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:3089870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,C13,D5
`Chr7:3089919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3089937`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B3,B97
`Chr7:3089937`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B3,B97
`Chr7:3089963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,C13,D5
`Chr7:3090011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:3090029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C1
`Chr7:3090205`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,B20,B25,B38,B39,B44,B59,C16,C27,C38,C55,C8
`Chr7:3090433`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B10,B107,B108,B121,B122,B129,B71,B87,C3,C50
`Chr7:3090462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B13,B66,B98,C45
`Chr7:3090488`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A15,A18,A5,B130,B131,B2,B3,B46,B72,B73,B76,B84,B85,B94,C45,D11,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771931.1

197 aa

197

Med31

PF05669 Med31 28-118 aa

XP_057771932.1

166 aa

166

Med31

PF05669 Med31 44-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771931.1`	Pfam	`PF05669`	Med31	Family	28	118	8.1e-28	97.0	SOH1
`XP_057771932.1`	Pfam	`PF05669`	Med31	Family	44	87	3e-07	31.0	SOH1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915948.1
TCACACTTGTTCTTCTCTTCTCTGCAACTTCCTCCATAGCCAGCTGTTCTTCAACATTCTTCTTCTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTCCGCTGGTGCTTCACACGCGAAGAACCTTTCTCCACTCCGTGCCCGGCACCAACGGCCGTGTCCAGCACGAGTCCGTGCGGCACGCCAGCGCGCGGCCCTCCTTCTTCGTCGGCTCGGTCCGGCATTAACAGATCCACTAGAAGTTCAT...

XM_057915949.1
AATTCCTTCGCTCTTGCCCTATATAGTAGGAACTAATTAATTAGGTTACTTGTGAAGTAGTTGAATCTCTTTATGTGTTGAAAGGCTGCAGAAATGCTCTGTTCCCTATGAAATTCGAGGGCTGTAACAAAATTATAAAAGAGTGATGTATGATTTTGGGTAGTGTGAGCTGTAATGGCGGTAATTTGATTTGCTGGATTCAGGTTGAAGAAAATCAGTAATTTCTTAAGTTTGAAGATCTGATGGTAGGTGGTGGACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991634
ATGGCGTACGATCCTATGGAATTAGTAACAAATCCTCCGTCGCCGCCCAAAACTGTGTACAAGGATCCAGATGATGACCGCCAGCGCTTTTTGCTTGAGCTCGAATTTGTCCAGTGCCTTTCTAATCCGACCTATATACATTCTCAAAACAGGTACTTTGAAGATGGGGCGTTTATCGGATACCTGAAATATCTTCAATATTTGCAAAGGCTTGAGTACTTAAAGTTTATTATGTATCCTCATTGCCTCTTTTTTCTCGA...

LOC130991634
ATGCTACATATCTTGGTTCTCTCTCTCCATTACAACTTTGCTACACTAACATCGAATTCCAGTGGGCAATGGTTACAGAAGCTGGTGGATGAAAAGCTATGCTTAACGTACAGGGATGGTCAGTCGACATATTCACTGAGGTATCCTCATTGCCTCTTTTTTCTCGAGCTTTTGCAGAATGTAAACTTCAGAAACGCAATGGCACATCCTGCAAACAAGGAGTTGGCGCATAGGCAACAGTTTTACTTCTGGAAGAATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771931.1
MAYDPMELVTNPPSPPKTVYKDPDDDRQRFLLELEFVQCLSNPTYIHSQNRYFEDGAFIGYLKYLQYLQRLEYLKFIMYPHCLFFLELLQNVNFRNAMAHPANKELAHRQQFYFWKNYRNNRLKHILPKPLPESSVGANPASAAPPALPPTTIPAAASGIPPAPPQAPSPMQYGMCAGSTFVKNDQKSSGVERRKRR

XP_057771932.1
MLHILVLSLHYNFATLTSNSSGQWLQKLVDEKLCLTYRDGQSTYSLRYPHCLFFLELLQNVNFRNAMAHPANKELAHRQQFYFWKNYRNNRLKHILPKPLPESSVGANPASAAPPALPPTTIPAAASGIPPAPPQAPSPMQYGMCAGSTFVKNDQKSSGVERRKRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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