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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000444`

染色体: Chr07 坐标: 3103823-3108034 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000444`
名称	SmilChr07G000444
描述	vesicle-associated protein 2-2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3103823 - 3108034 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991637`
GeneID	`130991637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991637`
原始查询	`SmilChr07G000444`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated protein 2-2
产物	vesicle-associated protein 2-2
Arabidopsis	`AT1G08820` (VAP27-2) vamp/synaptobrevin-associated protein 27-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837404] identity=37.6; qcov=1.12; evalue=1.26e-68; confidence=medium
Rice	`Os01g0936800` - identity=38.2; qcov=1.11; evalue=3.71e-71; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0061817 (GO:0061817); GO:0090158 (endoplasmic reticulum membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF00635 (Motile_Sperm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771936.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057771936.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771936.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771936.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3106515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr7:3106554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr7:3107131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B50,C30,C9,D7
`Chr7:3107749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B137,B27,B45,B49
`Chr7:3107774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771936.1

351 aa

176

351

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 6-112 aa

XP_057771937.1

351 aa

176

351

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 6-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771936.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	6	112	1.6e-28	99.5	MSP (Major sperm protein) domain
`XP_057771937.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	6	112	1.6e-28	99.5	MSP (Major sperm protein) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915954.1
CTTGTACCTTGGTTTAATGGTCGCCACCACACTGAATAATATGCTAGGAACCTCAACTTTATCACTTAAAGTCTACTCCATTTCTCTCTCGGTAAAAAGAAAATAAAAAAGAACCTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAAATTGAAACTCCATATACCGTCGTTTTTTCCGATCACCTACTTCAGCTGTTCTTTGTGAATGCCATAACTGTTTACGTTTTGAATTTGATTTATTGCTGCTGCGGAGGTC...

XM_057915953.1
GGTAAAAAGAAAATAAAAAAGAACCTTTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAAAATTGAAACTCCATATACCGTCGTTTTTTCCGATCACCTACTTCAGCTGTTCTTTGTGAATGCCATAACTGTTTACGTTTTGAATTTGATTTATTGCTGCTGCGGAGGTCCCAATCTGCTCACAAGCATCTCATTTTCGTTTCTAGGGCAAGGTAAAACCAAGGGCGGGATGCACTGTGTTTTGAATGAGTAGATCGTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991637
ATGAATACTCAACTTGTGGAGATTCAGCCTCGGGAACTTAAGTTCATATGTGAGGTGAAGAAACAGAGCTCATGTGCTGTTCACCTTCTGAATGCCACTGATCAGTATGTAGCTTTCAAGGTGAAAACTACATCGCCAAAGAAGTACTGCGTTAGGCCTAATATTGGTATAATCAAGCCAAAGGCGAATTATGATTTCACAGTTACCATGCAAGCCCAGAAATCTGTCCCCTCAGACATGCAGTGCAAAGATAAATTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771936.1
MNTQLVEIQPRELKFICEVKKQSSCAVHLLNATDQYVAFKVKTTSPKKYCVRPNIGIIKPKANYDFTVTMQAQKSVPSDMQCKDKFLIQSTVVPYGTSEEEITSSMFAKDSQKYIEETKLRVFLTSAPSSPVKPPATVISKQEPSNEILMSKHYSPDLMPVNGVIKQETHYETPIPQEHQSPVLLPVNGVNNQELHNEPPILKDTLQNGFEDSLPSDLLPIKPVEAVKFVKNMEESRSVKVMDSENSVPAKDDNSKQVQD...

XP_057771937.1
MNTQLVEIQPRELKFICEVKKQSSCAVHLLNATDQYVAFKVKTTSPKKYCVRPNIGIIKPKANYDFTVTMQAQKSVPSDMQCKDKFLIQSTVVPYGTSEEEITSSMFAKDSQKYIEETKLRVFLTSAPSSPVKPPATVISKQEPSNEILMSKHYSPDLMPVNGVIKQETHYETPIPQEHQSPVLLPVNGVNNQELHNEPPILKDTLQNGFEDSLPSDLLPIKPVEAVKFVKNMEESRSVKVMDSENSVPAKDDNSKQVQD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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