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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000447`

染色体: Chr07 坐标: 3137849-3140578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000447`
名称	SmilChr07G000447
描述	uncharacterized SmilChr07G000447
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3137849 - 3140578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991640`
GeneID	`130991640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991640`
原始查询	`SmilChr07G000447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsDeg-like; symbol=OsDeg-like; hit=Os03g0608600; species=rice; confidence=low
产物	OsDeg-like; symbol=OsDeg-like; hit=Os03g0608600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0608600` (OsDeg-like) - identity=27.3; qcov=0.675; evalue=1.16e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13365 (Trypsin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771946.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771946.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057771946.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771946.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3138116`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B102,B11,B111,B15,B17,B6,B95,C18,C57,C67,C7,C76,C83,C84
`Chr7:3138172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B102,B11,B111,B15,B17,B6,B86,B95,C18,C67,C7,C76,C83
`Chr7:3138234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B98,C14
`Chr7:3138264`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B128
`Chr7:3138264`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B128
`Chr7:3138361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D10
`Chr7:3138410`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B59,C11,C46
`Chr7:3138410`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B59,C11,C46
`Chr7:3138411`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B59,C11,C46
`Chr7:3138411`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B59,C11,C46
`Chr7:3138422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C46
`Chr7:3138424`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B59,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771946.1

320 aa

160

320

Trypsin_2

PF13365 Trypsin_2 44-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771946.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	44	237	6.3e-16	60.1	Trypsin-like peptidase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915963.1
CTTCTTCAATTTTCTGCTGCATTTTGATCTTATTATATCCAGGTATATCTCTTCTTCTTCATCTGCTATTCCTTCGCAAGGGCGGAAATATAAATACAAATTTTCTGCTGCATTTTGATCTTATTATATCCAAGTATTTAATAAAAAATTTGTTTTTATTAATCATAAATAATAAATATAAATACAAATTGGAAAATTCTGAAAATACTCTTAAGTTCTTGCGCATCCCCTTCGAAACCGAAACCAAATTAGCAAGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991640
ATGTCACAACTTTGTATTTCTATTGAGGATGACGGCGTACCAAAGTTCTACTCTACTATGCTGCCTGTTGTGTTTAACATTACATTTACACGTAAAATTGGACATGACAGTGATGATGATCGATTTTCTTGTACTGGATTTTGTATAAGCAGCACAGGGTTGCTAATGACATGTGCTCATTGTGTACCTTCTGAAAATGTGACATGTAGTATTATTGGTCGAAGAAGGGATGGATCTTGGACCCATGATATGACTGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771946.1
MSQLCISIEDDGVPKFYSTMLPVVFNITFTRKIGHDSDDDRFSCTGFCISSTGLLMTCAHCVPSENVTCSIIGRRRDGSWTHDMTAKIVKIFKKWDVCILQLVSKENVSFDFVTFANENDQICVGEDVHYIGGLAGLYFAYVKGMISCPCGYDLESITNIWKDRKPEDFTLMIKSYENYSLPPEMYGLGPPYTIRAGIAGYYHMHPLTPLIETNTMSYAGVASGSPLFNSRGQVIGMVIGGGRGTMATHHVILKFFMDKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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