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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000450`

染色体: Chr07 坐标: 3182082-3185392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000450`
名称	SmilChr07G000450
描述	tubby-like F-box protein 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3182082 - 3185392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991644`
GeneID	`130991644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991644`
原始查询	`SmilChr07G000450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 6
产物	tubby-like F-box protein 6
Arabidopsis	`AT2G47900` (TLP3) tubby like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819402] identity=66.2; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0667000` (OsTLP7) - identity=67.5; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01167 (Tub); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771951.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771951.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771951.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771951.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3182758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C40,C52,D8
`Chr7:3182817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:3182874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B114,B2,C13,D5
`Chr7:3182884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:3184449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:3184569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:3184855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:3184863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:3184869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:3185064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:3185067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:3185089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771951.1

396 aa

198

396

F-box-like

F-box

Tub

PF12937 F-box-like 44-88 aa PF00646 F-box 44-89 aa PF01167 Tub 105-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771951.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	44	88	5.8e-06	26.7	F-box-like
`XP_057771951.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	44	89	5.6e-05	23.6	F-box domain
`XP_057771951.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	105	391	3e-106	355.5	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915968.1
TTTATAATATCATTAGGTAAAGATTTGCTGTAACAGAGAATTGAATTATCAGGAAAAAAGTGGAGTTTTTTTTTTTTTTGGTAATATTAAAATCACAAATTCGAGTAATGCTATATTTATTGATTTAATTTACTCTAAAATCGTAATCTTTCATTTTCGTTACAGAATACAGACAATATATCTCGAATTCTCCACCTTTATTCTCGGAAAAAAAAAAAACCCTTGTTTTATCTCCCGTTCCTCATCTTGTTTGTACATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991644
ATGATGAAGCTGGGATTGAAATCACGGTCGCGGAGGGTGGTGCAGGACAGCTCAATGGCGGTGGAGAAATCGAAGATTTTCACGGGCAAAAATAAGAGCGATTCGGACGAAAGCTGCAGTTATTTCTGCTGGGCAAGTTTGCCGCCGGAGTTACTGAGGGAAGTATTGATGAAATTGGAGGAATCGGAGTCCAAGTGGCCGGCGAGGAAACACGTAGTGGCGTGTGCGGGTGTGTGTAAGAGCTGGAGAGAAGTGATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771951.1
MMKLGLKSRSRRVVQDSSMAVEKSKIFTGKNKSDSDESCSYFCWASLPPELLREVLMKLEESESKWPARKHVVACAGVCKSWREVMKDVVKTPEASGKITFPISVKQPGPRESLMQCFIKRNRSNQTYYLFLSLSQALADDGKFLLAARKCRRPTCTDYMISLHADDTSKGSETYVGKLRSNFLGTKFVVFDALPPHSGAKMAKSWSTRMVGSKQISPKLPAGNYTVAHVSYELNVLGARGPRRMHCVIDAIPVSAINPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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