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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000461`

染色体: Chr07 坐标: 3257516-3260803 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000461`
名称	SmilChr07G000461
描述	CASP-like protein 1E2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3257516 - 3260803 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991658`
GeneID	`130991658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991658`
原始查询	`SmilChr07G000461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1E2
产物	CASP-like protein 1E2
Arabidopsis	`AT4G15630` (AT4G15630) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827240] identity=49.1; qcov=0.894; evalue=2.34e-53; confidence=high
Rice	`Os01g0363300` - identity=42.4; qcov=0.833; evalue=3.28e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771972.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771972.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771972.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771972.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3257743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:3257772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr7:3257813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B70
`Chr7:3257825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B70
`Chr7:3257867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B86,C4,D2
`Chr7:3257873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B82
`Chr7:3257937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B56,B96
`Chr7:3260436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C33
`Chr7:3260467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:3260481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr7:3260517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C85
`Chr7:3260559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771972.1

198 aa

198

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 28-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771972.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	28	181	7.2e-41	140.1	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915989.1
AGAAAATTTTCACATATTTCCAAATTCCAATCTCACACAAACAGAAATTGAAGTCTTGGTGATTTCACACCAGCACCTCTATAAAAGGCGGCTGCAGCGCTTCACATTATTCACCCTCCTCTCTCATCAATTCTCTCTTCATTTTGTCCCCTACAAAAAGAGAGGAAGTTAAAGTAATAAATTTGTATTAATTTTTAGAAAATTGAAGATGTATTCTCAATATAAAAGCAGCAGCAATGGCGGAATTGAGAGTGGTGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991658
ATGTATTCTCAATATAAAAGCAGCAGCAATGGCGGAATTGAGAGTGGTGTGAGAGAGAGGGAAGTGGCGGTGGCCAACAAGAGAAGTATGAGGGGATGCGACGTCGTTTTGAGGTTCTTGGCTCTGGCGCTCGGCTTCGCCGCCGCGGTGGTTTTCGGCGTCAATAAGGAGACCGAAATGGTGGCGGTGACTTTGGTCGCCTCGCTGCCGCCGGTCAATATTCCGGCCACCGCCAAATGGAACTACTTGTCGGCCTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771972.1
MYSQYKSSSNGGIESGVREREVAVANKRSMRGCDVVLRFLALALGFAAAVVFGVNKETEMVAVTLVASLPPVNIPATAKWNYLSAFKYFVVANAIACGYAAISLVLTLANRNGRKGITTLVIILDLVMVALLFSALGAAGAIGLMAKQGNSHVQWNKVCDLFDKFCERGAASIGLSGAAAVAFFVLVVLAIFNLHKKH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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