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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000462`

染色体: Chr07 坐标: 3261344-3263473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000462`
名称	SmilChr07G000462
描述	transcription factor TT8-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3261344 - 3263473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991657`
GeneID	`130991657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991657`
原始查询	`SmilChr07G000462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TT8-like
产物	transcription factor TT8-like
Arabidopsis	`AT4G09820` (TT8) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826571] identity=28.3; qcov=0.691; evalue=2.18e-08; confidence=low
Rice	`Os04g0429300` (OsbHLH145) - identity=43.6; qcov=0.239; evalue=5.18e-07; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009960 (endosperm development); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771971.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771971.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771971.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771971.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3262306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr7:3262380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B63,C71,D10,D9
`Chr7:3262460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:3262962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C8
`Chr7:3263026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B35
`Chr7:3263032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B74,B75,C15,C54
`Chr7:3263051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D10
`Chr7:3263113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B53
`Chr7:3263163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:3263190`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B13,B137,B43,B87,D11
`Chr7:3263190`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B13,B137,B43,B87,D11
`Chr7:3263241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771971.1

230 aa

115

230

HLH

PF00010 HLH 69-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771971.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	69	117	1.1e-11	45.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915988.1
CTCTCAATTTTTATAGCCACTGTTTAAAATAATAATTGAAAATTATCTTATATTTATCCTATATTTAGATATGGAGGATATTTAAATATGGATACTTACTTTTTATAGCCACTATCTATATAATACTCTTCTCGTCCCCGCTATCTTGAGGCTTTTTTTAGACACGAGAATCAAGAAAGTAGTGTTTTGTATGTAGGTGAAAAAATAAAAATGTAAATATAGGATAAAATTTTTGCCAAATAAAAAAATGTCTCAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991657
ATGATCAAAATGAGCCAAGGGGAAAAGGGGGAATCGGGGAATCGGAGAATTAAAGAAGAGGAATTGAAGGATTTGTTTGTGGGAATTATGGAGGGATACAACGATTCTGCAATCCTGCCATTATCGTACTTCTCCGCTCCACAAATCCCTAATAATGAAGAAAACAGCCAGAATTCGAGAAAGATGCAGAAAACTGAATCCGAAAGAAAGCAGAGTGAGCGCAGGAGAAGGGATCAAATGAGTGAGAAATTTTCTCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771971.1
MIKMSQGEKGESGNRRIKEEELKDLFVGIMEGYNDSAILPLSYFSAPQIPNNEENSQNSRKMQKTESERKQSERRRRDQMSEKFSLLQSMVPSLLTAHKPSKERIVDDTLNYIKYLQEEAERLEGLKKLQSKLQKVERPTLSKCTNRNSVNVAISDSAAFLAIQLPSRRGSVLGILRVLERHQAEVMEARIDVSDEKVMTFTATVRLGGDGGSSIDMIRQDILTSLDLSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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