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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000488`

染色体: Chr07 坐标: 3409882-3411335 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000488`
名称	SmilChr07G000488
描述	uncharacterized SmilChr07G000488
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3409882 - 3411335 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991681`
GeneID	`130991681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991681`
原始查询	`SmilChr07G000488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=34.8; qcov=0.862; evalue=1.23e-30; confidence=low
Rice	`Os05g0403400` - identity=26.4; qcov=0.867; evalue=3.56e-17; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772007.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057772007.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772007.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772007.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3410089`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	B10,B107,B118,B122,B132,B140,B27,B3,B33,B36,B42,B47,B49,B53,B87,B90,B92,B95,B99,C10,C14,C21,C24,C31,C46,C80
`Chr7:3410168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,D6
`Chr7:3410191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	61	A3,A6,A7,A9,B100,B109,B11,B110,B113,B114,B121,B131,B132,B139,B17,B19,B24,B26,B28,B31,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B48,B5,B52,B59,B60,B73,B74,B77,B82,B86,B95,B98,C11,C12,C13,C20,C22,C29,C33,C34,C39,C46,C47,C61,C69,C70,C74,C83,C84,C9,D1,D11,D3,D6
`Chr7:3410192`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A23,A3,A9,B100,B109,B11,B110,B113,B114,B121,B132,B139,B17,B19,B24,B26,B28,B31,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B48,B5,B59,B60,B73,B77,B82,B86,B95,B98,C11,C12,C13,C20,C22,C33,C39,C46,C61,C69,C83,C84,C9,D11,D6
`Chr7:3410204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:3410210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C47
`Chr7:3410219`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A7,B112,B121,B31,B36,B48,B60,B73,C11,C29,C47,C61,C69
`Chr7:3410226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B72,B91
`Chr7:3410227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:3410228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B139
`Chr7:3410233`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A6,A7,B139,B52,B74,C34,C74,D3
`Chr7:3410238`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A6,B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772007.1

210 aa

105

210

mTERF

PF02536 mTERF 10-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772007.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	10	160	1.8e-14	54.1	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916024.1
CGACGCTTCTTGATTTCGAAACACTGAATACAGCTATTGAGCGCTTTCAATCTCGAACTCAGCAATGTTAAATTCAATCAGCAAAATGAAATTTCAAAGTGGAAGAATCTCGCATCTCACTTCACGTTCATCGTCATCCCCCAAATTATTTGCCCTAAAATTCAACCAGTTCGCATCATCACCTTCAAATGCCTCGAATTCAAACTCAGAAAATTCCAATCAAGACTCATTTCCTGCAACATATCTCCAAAATTCATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991681
ATGTATTGCTCTCTATCAAGAGGTGTGCCTGAACCCCACATTGCCACCCTACTGCGAATCAGCCCAGGAAAATTGGGCGTTCAACCCGAAAATTTTAGGGCAATGGTGGATGAGCTTCAAAAATTAGGGTTTAGACCTCAAAGAAGGAAGTTCATTGTGGGGATAATGGTGATGGGGCAATTAAGCAGTTCAACTTGGAAAGAGAAGATCCACTTCTATGAGAGGTTTGGTTGGTCTGAGCATGAGGTGTTGGATGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772007.1
MYCSLSRGVPEPHIATLLRISPGKLGVQPENFRAMVDELQKLGFRPQRRKFIVGIMVMGQLSSSTWKEKIHFYERFGWSEHEVLDAFMKHPRFMSASADKITRALDLLVNPMGCDPSVLIKWPQILTLNFERTLVPRCAFHHVLVSKGLVGPGSLLQMLSHLRSLSLESFELSCAEKDPQLLRLYVRKFLASRRSVIFSRMMESSDQKKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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