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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000489`

染色体: Chr07 坐标: 3413292-3415516 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000489`
名称	SmilChr07G000489
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3413292 - 3415516 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993057`
GeneID	`130993057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993057`
原始查询	`SmilChr07G000489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=33.7; qcov=0.75; evalue=3.45e-74; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=33.5; qcov=0.935; evalue=2.28e-83; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773759.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773759.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773759.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773759.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3413310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr7:3413320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C9
`Chr7:3413410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B35
`Chr7:3413440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B77,C49
`Chr7:3413441`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	72	A13,A20,A25,A3,A4,A5,B107,B109,B11,B115,B117,B12,B120,B121,B125,B127,B129,B13,B135,B136,B20,B22,B25,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B51,B55,B60,B61,B64,B66,B68,B7,B71,B72,B77,B81,B84,C17,C20,C21,C28,C3,C31,C32,C39,C41,C42,C5,C52,C55,C58,C6,C61,C63,C64,C66,C70,C74,C75,C83,C87,C9,D2,D5,D8
`Chr7:3413445`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A13,A14,A20,A25,A3,A4,A5,B107,B109,B11,B110,B115,B117,B12,B120,B121,B125,B127,B129,B13,B135,B136,B20,B22,B25,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B51,B55,B60,B61,B64,B66,B68,B7,B71,B72,B77,B81,B84,B93,B94,C17,C20,C21,C28,C3,C31,C32,C39,C41,C42,C5,C52,C55,C58,C6,C61,C63,C64,C66,C70,C74,C75,C83,C87,C9,D2,D5,D8
`Chr7:3413484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C35,C63
`Chr7:3413517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	83	A16,A18,A19,A2,A7,A9,B1,B100,B102,B103,B105,B106,B110,B112,B113,B114,B117,B123,B124,B131,B134,B138,B139,B14,B15,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B41,B42,B43,B44,B46,B50,B53,B55,B63,B65,B68,B70,B74,B79,B80,B82,B86,B89,B96,B97,C10,C13,C2,C23,C25,C26,C29,C33,C34,C36,C38,C39,C44,C46,C53,C55,C56,C6,C72,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C9,D10,D5,D7,D9
`Chr7:3413568`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr7:3413568`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr7:3413577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:3413586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B52,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773759.1

696 aa

348

696

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 146-319 aa PF23559 WHD_DRP 402-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773759.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	146	319	9.7e-42	143.2	NB-ARC domain
`XP_057773759.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	472	4.7e-20	72.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917776.1
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCGTCTCCATCCTTCAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCACGCTGGATTCTTGATCACAACAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTGCTTCTCTGCACCAGATTCTCGAAAAATCTTCACTCCCCAAAAATATAGAGAATTTGGAAAGTCAAATCCAAGAAGCAGCACATAGAGCAGAAGATATCATTGAATCTCAGATGGTTGCTCAAATGCTTTCCAGCCCTAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993057
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCGTCTCCATCCTTCAACAAATCTTGAATCCTGAACAATCACGCTGGATTCTTGATCACAACAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTGCTTCTCTGCACCAGATTCTCGAAAAATCTTCACTCCCCAAAAATATAGAGAATTTGGAAAGTCAAATCCAAGAAGCAGCACATAGAGCAGAAGATATCATTGAATCTCAGATGGTTGCTCAAATGCTTTCCAGCCCTAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773759.1
MAYNLQPLVSILQQILNPEQSRWILDHNKPQLQSLLQKAASLHQILEKSSLPKNIENLESQIQEAAHRAEDIIESQMVAQMLSSPKGVSFTFSTPDLQQVMQQLDSVMEQVVKLAEGKTMSSGSSTSGASLLQDPSSKSIVVGVDEDLAKLKDRLTGMQSKLEIVPIVGMGGIGKTTLARKLYEDPSIVEHFSYLAWTTISQDYNMRSILLSLLRCIIGKEECDKHNEKVDSELKDILYRSLYGRIYMIVLDDIWSTTFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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