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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000492`

染色体: Chr07 坐标: 3426124-3427320 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000492`
名称	SmilChr07G000492
描述	uncharacterized SmilChr07G000492
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3426124 - 3427320 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993058`
GeneID	`130993058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993058`
原始查询	`SmilChr07G000492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=35.6; qcov=0.889; evalue=2.8e-68; confidence=medium
Rice	`Os07g0423000` - identity=26.5; qcov=0.892; evalue=6.85e-43; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057773760.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057773760.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773760.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773760.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3426149`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	196	A1,A10,A13,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B95,B96,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D9
`Chr7:3426214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr7:3426242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B120,B16,B61,D2
`Chr7:3426340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C47
`Chr7:3426349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C64,C66
`Chr7:3426384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B75,C45
`Chr7:3426411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B16,B75,C45,C8
`Chr7:3426430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:3426459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B48,B78,D7
`Chr7:3426466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,B95,C26,C39
`Chr7:3426493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C11,C69
`Chr7:3426949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773760.1

398 aa

199

398

mTERF

PF02536 mTERF 90-300 aa PF02536 mTERF 263-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773760.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	90	300	2.9e-39	135.6	mTERF
`XP_057773760.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	263	360	2.9e-39	135.6	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917777.1
ATGTTTGCTCAAATTCGCAAATTCAAATTCTGTGATGTAAGATTCTCTCACGTTGCTTGCTCCCAATCACTCGCCAATTACATTCTCCTACAGCTCCACCAATTTTCATCACCAGCTACAAATGCCCTAGAATCGAGCTCAAAAGATCCGAATCCGAAGTCATTCGCCGCGGTTTATCTAGAAAACAATTACGGGGTTCCCCCAAAACGAGTCCTAAGTTATTCTAAGCACCTCAACTTCGATTCCCCTGAAAAACCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993058
ATGTTTGCTCAAATTCGCAAATTCAAATTCTGTGATGTAAGATTCTCTCACGTTGCTTGCTCCCAATCACTCGCCAATTACATTCTCCTACAGCTCCACCAATTTTCATCACCAGCTACAAATGCCCTAGAATCGAGCTCAAAAGATCCGAATCCGAAGTCATTCGCCGCGGTTTATCTAGAAAACAATTACGGGGTTCCCCCAAAACGAGTCCTAAGTTATTCTAAGCACCTCAACTTCGATTCCCCTGAAAAACCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773760.1
MFAQIRKFKFCDVRFSHVACSQSLANYILLQLHQFSSPATNALESSSKDPNPKSFAAVYLENNYGVPPKRVLSYSKHLNFDSPEKPLYAIAFLKKHHFTDSDISRIVKKWPVVLTCGLESNFLPKFEFLRSLGLSSSEFVKILTLQPRLINRSLEGQIIPCVDFLRGFLGSDKDVVFSILRYPGILGESLQKTLLPNVGILRDAGVPESHIAALLRAASRGLALDPGNFKLTVQEVINLGFNPATKAFIRGLKVMRQLNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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