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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000494`

染色体: Chr07 坐标: 3435676-3446234 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000494`
名称	SmilChr07G000494
描述	protein ALWAYS EARLY 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3435676 - 3446234 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991684`
GeneID	`130991684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991684`
原始查询	`SmilChr07G000494`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALWAYS EARLY 3-like
产物	protein ALWAYS EARLY 3-like
Arabidopsis	`AT3G21430` (ALY3) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821697] identity=48.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0193900` (OsALYL1) - identity=58.3; qcov=0.152; evalue=1.88e-60; confidence=weak
GO	GO:0000003 (GO:0000003); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0017053 (transcription repressor complex); GO:0051726 (regulation of cell cycle)
KEGG	-
Pfam	PF06584 (DIRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772013.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772013.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772013.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772013.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3436900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B136,B37,C85
`Chr7:3439018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:3439019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:3439038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B33
`Chr7:3439707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B120,B16,B61,D2
`Chr7:3439812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B107,B41,B44,C10
`Chr7:3439833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:3439834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C11,C69
`Chr7:3439914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B24
`Chr7:3440321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B33
`Chr7:3441928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr7:3442041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B120,B16,B61,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772013.1

1144 aa

572

1144

DIRP

PF06584 DIRP 643-744 aa

XP_057772014.1

1107 aa

554

1107

DIRP

PF06584 DIRP 606-707 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772013.1`	Pfam	`PF06584`	DIRP	Family	643	744	5.4e-34	117.3	DIRP
`XP_057772014.1`	Pfam	`PF06584`	DIRP	Family	606	707	5.1e-34	117.3	DIRP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916031.1
AGAATAAAATAAAAATTAAAAACATAAATTCATTCTTCTTCCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAACACTCTCCTTTCTCTCTCTAAAGTCTCACTCAATCGCAGAAAAATCGTAATCGTATCCCTCTCGCCACCAATTATCTATAAATTTCGAATCTGGAGCGTTTCCTCAAATGCTGTGAATTGAATTCGTTGGAAAGGTTCGTAGATTAGCACATAATGGGACCCACGAGAAAGTCGAGAAGTGTGAATAAGCG...

XM_057916030.1
ATAAAAATTAAAAACATAAATTCATTCTTCTTCCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAAACACTCTCCTTTCTCTCTCTAAAGTCTCACTCAATCGCAGAAAAATCGTAATCGTATCCCTCTCGCCACCAATTATCTATAAATTTCGAATCTGGAGCGTTTCCTCAAATGCTGTGAATTGAATTCGTTGGAAAGGTTCGTAGATTAGCACATAATGGGACCCACGAGAAAGTCGAGAAGTGTGAATAAGCGCTATTCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991684
ATGGGACCCACGAGAAAGTCGAGAAGTGTGAATAAGCGCTATTCTTATATCCACGAGGTATCTCCTAGCAAAGATGGAGATAGTGCTAAAAAAAGTAGCAGTCGGAAAAGAAAGTTGTCTGACATGCTTGGGCCTCGGTGGACCATGGAAGAGCTAACTCGTTTCTATGACTCTTACCGCAAGTACAGTAAAGACTGGAAGAAGGTAGCCGGTGCTGTCAGAAATCGTTCAGCGGAAATGGTGGAGGCCCTTTACACAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772013.1
MGPTRKSRSVNKRYSYIHEVSPSKDGDSAKKSSSRKRKLSDMLGPRWTMEELTRFYDSYRKYSKDWKKVAGAVRNRSAEMVEALYTMNRAYLSLPHGTASAAGLIAMMTDHYSNLAGSDSDQENNDGAGSSQKTQKRARGKVQPPTPKASDEHIASQSPITASNYGCLSLLKKKRSGGSRPRPVGKRTPRFPVSFSYENINGEKFFSPTRQGLKLKANADDDEVAHEIAIALAEASQRGGSPQVSGTLNKRAESVMSSPF...

XP_057772014.1
MGPTRKSRSVNKRYSYIHEVSPSKDGDSAKKSSSRKRKLSDMLGPRWTMEELTRFYDSYRKYSKDWKKVAGAVRNRSAEMVEALYTMNRAYLSLPHGTASAAGLIAMMTDHYSNLAGSDSDQENNDGAGSSQKTQKRARGKVQPPTPKASDEHIASQSPITASNYGCLSLLKKKRSGGSRPRPVGKRTPRFPVSFSYENINGEKFFSPTRQGLKLKANADDDEVAHEIAIALAEASQRGGSPQVSGTLNKRAESVMSSPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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