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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000497`

染色体: Chr07 坐标: 3463306-3471702 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000497`
名称	SmilChr07G000497
描述	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3463306 - 3471702 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991688`
GeneID	`130991688`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991688`
原始查询	`SmilChr07G000497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 3-like
产物	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 3-like
Arabidopsis	`AT3G62900` (AT3G62900) CW-type Zinc Finger [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825465] identity=43; qcov=0.214; evalue=1.02e-59; confidence=weak
Rice	`Os07g0669800` (OsCW-ZF7) Cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4344236] identity=44.3; qcov=0.168; evalue=1.49e-42; confidence=weak
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF07496 (zf-CW); PF24756 (THD_CWZF3-5-7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991688

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772023.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057772023.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772023.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772023.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3464729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B72
`Chr7:3464753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B20,C2,C42,C8
`Chr7:3465153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:3465525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:3465535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B16,B61,D2
`Chr7:3465564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:3465693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C5
`Chr7:3465711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:3465726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B74
`Chr7:3465794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B20,C2,C42,C8
`Chr7:3465999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B37,C52,C85
`Chr7:3466054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772023.1

1506 aa

753

1506

zf-CW

THD_CWZF3-5-7

PF07496 zf-CW 577-623 aa PF24756 THD_CWZF3-5-7 1261-1497 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772023.1`	Pfam	`PF07496`	zf-CW	Domain	577	623	5.3e-15	55.9	CW-type Zinc Finger
`XP_057772023.1`	Pfam	`PF24756`	THD_CWZF3-5-7	Domain	1261	1497	1.3e-62	212.5	CWZF3-5-7 THD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916040.1
CACCGCCCCCTTCTTCCCCCCTCATATGGTGTCTGTATGCAATAACAAAAAATATACATACATATTACATACACTTAAATTAACAAAAAAAAAACAACAAATAAGGAGCATTACATTGAGAATCGCCTCGATCGTTACTCAATTCCTGCGAAAAATTGATTCTTTTGGATTGCGCTTACTCGTTTCCGTTTAGGAGTTTATGCGAATACATTTGGCACACGTGTGCTTCTGTATATGGTGGTGATCAACCATTGTCTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991688
ATGGTTCAGGAGCCTGAGCTTGAAGAAGGAGAGACTTGCTATTACAATGATGATGCAACCATTGATCCTGATATAGCTCTCTCTTACATTGGAGAGAAGGTTCAGAGTATACTGGGCCATCTGCAGAAAGATTTTGAAGGCGGGGTTTCTGCGGAAAATTTGGGGGCAAAGTTTGGTGGATATGGCTCGTTTTTACCCACACATCAACGCTCTCCTTCAATTTGGTCGCAGCCAAAATCTCCACCAAGAGTTCAAAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772023.1
MVQEPELEEGETCYYNDDATIDPDIALSYIGEKVQSILGHLQKDFEGGVSAENLGAKFGGYGSFLPTHQRSPSIWSQPKSPPRVQNSHLPRSPNACPEGPPQKSITPSTHRDDASSSPGARASQTLKTSSHRQKATLSSGKVTETFPGKNELPSSKLGNPLDQRTLKVRIKVGPERVARYNAQIHSLGLTSPSSSEGNSHDESDELLIETCEIPNESPAYMLKTMTSFPMSDGFLLSPLCEDLLNLTREREYKLESEHEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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