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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000498`

染色体: Chr07 坐标: 3479401-3481943 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000498`
名称	SmilChr07G000498
描述	protein SRG1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3479401 - 3481943 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991689`
GeneID	`130991689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991689`
原始查询	`SmilChr07G000498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SRG1
产物	protein SRG1
Arabidopsis	`AT3G21420` (LBO1) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821696] identity=69.6; qcov=0.906; evalue=2.55e-179; confidence=high
Rice	`Os01g0935400` - identity=61.8; qcov=0.876; evalue=3.05e-161; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00906 (Carotenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772025.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772025.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772025.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772025.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772025.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3479525`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B75
`Chr7:3479525`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B75
`Chr7:3479528`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr7:3479528`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr7:3479541`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A5,B85,C38,C51
`Chr7:3479541`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A5,B85,C38,C51
`Chr7:3479549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr7:3479554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B33
`Chr7:3479568`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119
`Chr7:3479568`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B119
`Chr7:3479591`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A10,A18,A24,B10,B104,B107,B115,B117,B119,B120,B121,B125,B126,B16,B2,B25,B28,B31,B46,B51,B54,B59,B61,B69,B7,B71,B72,B80,B87,B90,B92,B98,C11,C16,C21,C29,C52,C55,C60,C65,C69,C7,C70,C75,C83,C87,D2,D3,D6
`Chr7:3479601`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A4,B111,B5,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772025.1

403 aa

202

403

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 99-206 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 253-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772025.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	99	206	6.4e-32	111.4	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057772025.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	253	352	7.7e-34	116.8	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916042.1
GTCCCATTAAAGAATTTTCAAGAATCATGCCCATAATACAATGGCCATTACCAAGATCACTATTTTTTGCCAAAATTTTGTTGTTTCAAAATTATTGAAAAAGTTACAAGAATGCATACAAAGTCCAGCCATTTGGACCCCTACCAATCCCTCCCATCTATAAATACTGGCCTTCTCCTCATCAAGGCATCAAACCACCTTAAAGAAAAAAACAAACATATTTTTCCTCAGCATTTTCCCACTCTTACAATGGCTCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991689
ATGCATACAAAGTCCAGCCATTTGGACCCCTACCAATCCCTCCCATCTATAAATACTGGCCTTCTCCTCATCAAGGCATCAAACCACCTTAAAGAAAAAAACAAACATATTTTTCCTCAGCATTTTCCCACTCTTACAATGGCTCCAGCTCCAATCTCAGGCATCAAAGTAGGCCACATAGATGATGTTCAAGAGCTAAGAAGAGGTGGGAAATCCTCACACATCCCTGCAAGATTCATCCGCGACACCACGGAGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772025.1
MHTKSSHLDPYQSLPSINTGLLLIKASNHLKEKNKHIFPQHFPTLTMAPAPISGIKVGHIDDVQELRRGGKSSHIPARFIRDTTERPALDKAIFCSDTIPVIDLSKLHKGSSDEMHKLMSSCQEWGFFQVVNHGVDVELVEGIERVAMEFFKMPLEEKQKYPMNPGTVQGYGQAFIFSEDQKLDWCNMFALGVIPDYIRNPKLWPSKPADFSETVDTYSTQIRLLCKNLLKHIATTLALKEDVFEEMFGVAVQAVRMNYY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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