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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000509`

染色体: Chr07 坐标: 3581594-3584044 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000509`
名称	SmilChr07G000509
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3581594 - 3584044 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991700`
GeneID	`130991700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991700`
原始查询	`SmilChr07G000509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT5G03100` (AT5G03100) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831808] identity=31.3; qcov=0.543; evalue=9.32e-21; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=28.1; qcov=0.53; evalue=2.7e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772040.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772040.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772040.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772040.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3582231`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A8,B65,C34
`Chr7:3582231`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A8,B65,C34
`Chr7:3582242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B87
`Chr7:3582324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:3582406`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr7:3582406`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr7:3582541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B60,B72,C29
`Chr7:3582651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B35,C28,C83
`Chr7:3582689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:3582744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr7:3582755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B115,C27,C5
`Chr7:3582758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B139,B97,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772040.1

477 aa

238

477

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 45-83 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 106-447 aa PF24758 LRR_At5g56370 125-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772040.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	45	83	3.7e-06	27.3	F-box domain
`XP_057772040.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	106	447	5.8e-10	39.8	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772040.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	125	265	5e-12	46.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916057.1
CACGTTTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTCCCGCTAATACCATAACCTCCTTCATCTGCTCAGAAACCCTTTCCTCAAAAATTCACCGACTCTCCCTCAATTTCCGACGATTTCTTCCGCCTACACTTCTCTCAACTCATCTCTCGCTAATCCTCTCGTTCCTTAACAAAATGAAGGGGAAATTCCTAAATATGCAATTCTCTCGTCCCGCTCCCTTTTCTCCATAAATTCCGACGAAGACTACTCATTTACAATAGGGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991700
ATGGATGGATGGGAAGATTATTACAGAACTGCAGAAGCAAACAGACGTCGAGATCCTATTTGGATTAGTCAAACAATGGATGGATGGGAAGATTATTACAGAACTGCAGAAGCAAACAGACGTCGAGATCGACTCAGTGAGTTACCCGACTCTTTAATTCTTACGATCCTTTCATTGTTGGATATGAGAGATGCTGTTCGGACAACCCTTATCTCCCAACGCTGGAGAAACCTCTGGTCCACCATCCCCTGCCTTGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772040.1
MDGWEDYYRTAEANRRRDPIWISQTMDGWEDYYRTAEANRRRDRLSELPDSLILTILSLLDMRDAVRTTLISQRWRNLWSTIPCLVFFEQTPSTISSILAQWKGPKILKFCLSFRRLTVGPSSVIDSWLIFAIEKQVEELFLVLTNWRYRDSYFLPQPLYSCSSITKLTLEDCNLRIEENVQWNQLRILNIKYMDGLSGDAMNQILLGAPRLEELVLEDLNIGEDENFNIRSTSLKMLKIHMCQWPETTVLSIWAPNLLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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