当前解析结果
SmilChr07G000513| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000513 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000513 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000513 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3607810 - 3608845 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993060 |
|---|---|
| GeneID | 130993060 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993060 |
| 原始查询 | SmilChr07G000513 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993060 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773762.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773762.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773762.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773762.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773762.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3608247 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr7:3608247 |
GAA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:3608299 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 146 | A1,A13,A14,A15,A16,A19,A21,A22,A23,A3,A5,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B12,B123,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B136,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B22,B23,B25,B29,B3,B30,B34,B35,B40,B42,B43,B46,B47,B48,B53,B55,B59,B6,B60,B63,B64,B66,B67,B68,B70,B71,B75,B77,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B91,B93,B94,B95,B97,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C31,C35,C37,C38,C39,C41,C42,C43,C48,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C58,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C86,C9,D1,D11,D3,D4,D5,D7,D8,D9 |
Chr7:3608334 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 27 | A10,A18,A3,B100,B11,B118,B129,B139,B25,B38,B39,B44,B46,B59,B81,C12,C33,C35,C37,C4,C42,C46,C47,C62,C8,C86,D8 |
Chr7:3608337 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 27 | A10,A18,A3,B100,B11,B118,B129,B139,B25,B38,B39,B44,B46,B59,B81,C12,C33,C35,C37,C4,C42,C46,C47,C62,C8,C86,D8 |
Chr7:3608549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C87 |
Chr7:3608566 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B57,B91 |
Chr7:3608566 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B57,B91 |
Chr7:3608567 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,C11,C69 |
Chr7:3608624 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,B49,B80 |
Chr7:3608696 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 157 | A1,A10,A15,A18,A2,A20,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B113,B117,B118,B122,B123,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B38,B39,B4,B41,B44,B45,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B6,B61,B62,B63,B65,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B78,B79,B8,B81,B83,B85,B86,B87,B89,B90,B92,B93,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C38,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C77,C81,C82,C83,C86,D1,D11,D2,D4,D9 |
Chr7:3608762 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。