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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000514`

染色体: Chr07 坐标: 3610239-3612450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000514`
名称	SmilChr07G000514
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3610239 - 3612450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991705`
GeneID	`130991705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991705`
原始查询	`SmilChr07G000514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772046.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772046.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772046.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772046.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3610490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B139,B97,C38
`Chr7:3610590`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A6,C4
`Chr7:3610590`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A6,C4
`Chr7:3610631`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B103,B120
`Chr7:3610631`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B103,B120
`Chr7:3610684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:3610750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:3610793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B130
`Chr7:3610912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,B98,D11
`Chr7:3611018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C24,C36
`Chr7:3611022`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A14,A19,B103,B120,B136,B31,B54,B9,C15,C52,C60,C75,C87,D3,D4
`Chr7:3611028`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A22,B54,B69,C19,C49,C75,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772046.1

483 aa

242

483

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 27-64 aa PF24758 LRR_At5g56370 110-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772046.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	27	64	2.3e-07	31.2	F-box domain
`XP_057772046.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	110	251	6e-11	43.1	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916063.1
TATTGAGAGCATATTTTGCCCATTTAGCGTAGGGTTTTCACTTTCCTCGAAAATTATTTCCATAAAGTTAATCCTCCCTACTACCACTACTCATTCAATCCCAAGAATCAATTTCTAAAGAATCCGGTCCACTTTTTAGTCGAATTTGGATTAGTCAAACAATGGATGAATCGCACGTTTCTGATAGCGAAGAAGATTACGGAACTGTAGAAGCAAACAGCGGTGAGCGGCACGATCGATTCAGTGAGTTACCCGACTCT...

XM_057916064.1
ATTGAGAGCATATTTTGCCCATTTAGCGTAGGGTTTTCACTTTCCTCGAAAATTATTTCCATAAAGTTAATCCTCCCTACTACCACTACTCATTCAATCCCAAGAATCAATTTCTAAAGAATCCGGTCCACTTTTTAGTCGAATTTGGATTAGTCAAACAATGGATGAATCGCACGTTTCTGATAGCGAAGAAGATTACGGAACTGTAGAAGCAAACAGCGGTGAGCGGCACGATCGATTCACAACACAATTTGAAATGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991705
ATGGATGAATCGCACGTTTCTGATAGCGAAGAAGATTACGGAACTGTAGAAGCAAACAGCGGTGAGCGGCACGATCGATTCAGTGAGTTACCCGACTCTTTAATTCTTACGATCATTTCATTGTTGGATATGAGAAATGTTGTTCGGACATCCCTTCTCTCCAAACGTTGGAAAAACATCTGGTCCACTATCCCCTGCCTTGATTTCATCGATTTCGAACAAACTCCAAGTATTATTTCTAGTGTTCTTTCACAATGGAA...

LOC130991705
ATGGATGAATCGCACGTTTCTGATAGCGAAGAAGATTACGGAACTGTAGAAGCAAACAGCGGTGAGCGGCACGATCGATTCACAACACAATTTGAAATGTTTAATCATGTTTTTCGAAGCATCCGCCATGTTGAGAAGGTCACTTTATCACATTGGTGTATTGAGATGCTTGTCCAATTAAAGACAAAATATATGGTCATGCCGTTGTCAAATTCTAAGATTCTAGAGCTTTATTATGTAAATGCCAAAGATATACTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772046.1
MDESHVSDSEEDYGTVEANSGERHDRFSELPDSLILTIISLLDMRNVVRTSLLSKRWKNIWSTIPCLDFIDFEQTPSIISSVLSQWKGPKILKFRLSFPNFIVGPSSVMDSLLHFAIEKQVAELFLYFYFWECVNSNGKDIYCLPQPLYSCSSITKLTLEVCELRIEGNVQWHQLKILKLVYVDGLSGDAMNQILLGAPLLEVLVLESFEIGENENFNIRSTSLKMLKIHTDYICPETTVLRIWAPNLLTLNISACFYGT...

XP_057772047.1
MDESHVSDSEEDYGTVEANSGERHDRFTTQFEMFNHVFRSIRHVEKVTLSHWCIEMLVQLKTKYMVMPLSNSKILELYYVNAKDILDLVEMMFPKLERLIVDQGDQGFDGTYGEEVHIAMVDACNSLASAKMTFPSPSLLRLKTFEATWSISKPSIIPVIQVLLESAPVLEKMVLRLRQDASYPKTFILAQEKVLSMPRSSPTAQVIITDDFGITDKSSSTCSCSSCNY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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