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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000526`

染色体: Chr07 坐标: 3664760-3666155 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000526`
名称	SmilChr07G000526
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g78750-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3664760 - 3666155 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991712`
GeneID	`130991712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991712`
原始查询	`SmilChr07G000526`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g78750-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g78750-like
Arabidopsis	`AT5G22670` (AT5G22670) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832330] identity=27.1; qcov=0.967; evalue=1.58e-16; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772056.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772056.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772056.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772056.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3664772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B118,B61,C75,C83
`Chr7:3664778`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	119	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A23,A24,A4,A5,A7,A8,B100,B101,B105,B108,B109,B112,B113,B114,B117,B118,B123,B124,B125,B126,B128,B13,B131,B134,B137,B138,B139,B14,B18,B2,B22,B23,B25,B26,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B59,B65,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B8,B80,B81,B88,B96,B97,B98,C1,C11,C13,C16,C17,C2,C22,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C36,C38,C45,C47,C48,C53,C54,C56,C58,C59,C61,C62,C68,C69,C70,C71,C74,C77,C78,C8,C80,C82,C83,D11,D2,D4,D7,D8
`Chr7:3664779`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	117	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A23,A24,A4,A5,A7,A8,B100,B101,B105,B108,B109,B112,B113,B114,B117,B118,B124,B125,B126,B128,B13,B131,B134,B137,B138,B139,B14,B18,B2,B22,B23,B25,B26,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B59,B65,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B8,B80,B81,B88,B96,B97,B98,C1,C11,C13,C16,C17,C2,C22,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C36,C38,C45,C47,C48,C53,C54,C56,C58,C59,C61,C62,C68,C69,C70,C71,C74,C77,C78,C8,C80,C82,C83,D11,D2,D4,D7,D8
`Chr7:3664802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:3664827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B87,C52
`Chr7:3664883`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B119,B23,B29,B68,B72,C2,C20,C31,C41,C43,C80,C86
`Chr7:3664886`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B119,B23,B29,B68,B72,C2,C20,C31,C43,C80,C86
`Chr7:3664890`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B67,B93
`Chr7:3664890`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B67,B93
`Chr7:3664902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C63
`Chr7:3664985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C54
`Chr7:3665006`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A4,B113,B4,B59,B62,B65,B79,B80,B90,B91,B92,C18,C19,C34,C47,C59,C62,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772056.1

359 aa

180

359

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 15-157 aa PF24758 LRR_At5g56370 18-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772056.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	15	157	1.3e-11	45.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772056.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	18	151	3.3e-13	50.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916073.1
GATTATGAAGTTCACCATAATCTTCTTTGGTCATCGTTTGAGCCCATCTACTGATATTGATTCGTGGCTGCGTTTTGCGATCGAAAAACAAGTGGAAAAGCTAATTGTAGGTTTCGACTGTGAACCGCATGGGGCATACTTGGTTCCGCAGTGTTTGTATTCATGCTCATCAATTACAGAATTATCCCTATACAAGTGTTCGTTGAAAATCGAGAGGAATGTGCAGTGGAATCAACTCAAGAGATTACACATTTGGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991712
ATGAAGTTCACCATAATCTTCTTTGGTCATCGTTTGAGCCCATCTACTGATATTGATTCGTGGCTGCGTTTTGCGATCGAAAAACAAGTGGAAAAGCTAATTGTAGGTTTCGACTGTGAACCGCATGGGGCATACTTGGTTCCGCAGTGTTTGTATTCATGCTCATCAATTACAGAATTATCCCTATACAAGTGTTCGTTGAAAATCGAGAGGAATGTGCAGTGGAATCAACTCAAGAGATTACACATTTGGAATCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772056.1
MKFTIIFFGHRLSPSTDIDSWLRFAIEKQVEKLIVGFDCEPHGAYLVPQCLYSCSSITELSLYKCSLKIERNVQWNQLKRLHIWNPDGSSGDAMNQILVGAPLLEELFYGTFEISENFNIRSTRLKMLEMSKCNVKAEAELRIWAPNLLKLKFSGDVCGSCLLCVPSLTTATLCFDDDSITREDMAPLGMFRQVFRSIRHVENVSLSNWSIQFLVDTKKKNMPVQFPNAEFLRLCAVKDQQMHDVLVVLESFPKLKTLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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