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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000531`

染色体: Chr07 坐标: 3687810-3689693 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000531`
名称	SmilChr07G000531
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3687810 - 3689693 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991717`
GeneID	`130991717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991717`
原始查询	`SmilChr07G000531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT4G13965` (AT4G13965) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031] identity=29.8; qcov=0.698; evalue=3.7e-15; confidence=low
Rice	`Os10g0126800` (OsFbox514) - identity=44.9; qcov=0.195; evalue=1.13e-13; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772061.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772061.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772061.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772061.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3687899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr7:3687905`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B137
`Chr7:3687905`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B137
`Chr7:3687907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A4,B12,B55
`Chr7:3687921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A4,B12,B55
`Chr7:3687940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:3688134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B57
`Chr7:3688148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B57
`Chr7:3688208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:3688275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr7:3688287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C83
`Chr7:3688336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B41,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772061.1

428 aa

214

428

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-55 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 76-396 aa PF24758 LRR_At5g56370 98-333 aa

XP_057772062.1

400 aa

200

400

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-55 aa PF24758 LRR_At5g56370 77-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772061.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	55	5.8e-05	23.6	F-box domain
`XP_057772061.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	76	396	5.3e-09	36.7	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772061.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	98	333	7.2e-14	52.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057772062.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	55	5.2e-05	23.7	F-box domain
`XP_057772062.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	77	305	1.1e-13	52.1	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916078.1
CGACGTTTGGCGGTATAATATGAAAACCCTCCTTCCCCAATTTTGAAAGAAGTGGCTAGTTTTGAGCCCTAGCTACTCAAACAATGGATGAATCGCAGGATTCCGAATCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATGCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCGTTGTTGTGGTCGAGAGAGGTTGTTAGGACTACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCCGCTTTGATTTTGATTTT...

XM_057916079.1
CGACGTTTGGCGGTATAATATGAAAACCCTCCTTCCCCAATTTTGAAAGAAGTGGCTAGTTTTGAGCCCTAGCTACTCAAACAATGGATGAATCGCAGGATTCCGAATCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATGCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCGTTGTTGTGGTCGAGAGAGGTTGTTAGGACTACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCCGCTTTGATTTTGATTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991717
ATGGATGAATCGCAGGATTCCGAATCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATGCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCGTTGTTGTGGTCGAGAGAGGTTGTTAGGACTACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCCGCTTTGATTTTGATTTTTGTGATGAAGATCCAAACTTTATCCGTGGGGCTCTTGTACAATGGAAAGGTGCCAAGATTCTCAGTTTTAGCATAGGTCTCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772061.1
MDESQDSESGSLDRLSDLPDALILEILSLLWSREVVRTTILSKRWKDLWTTVPRFDFDFCDEDPNFIRGALVQWKGAKILSFSIGLINNDPPSSDIIDSLLLLAMEKQVEELAVYLMPPLSIEYYAPRRLCSCSSITRLCLSYCSMQIEENVQWNQLISLTLEHNDPVKVSAVTMNRILSGAPRLERLILQPLEVNENFYIRSTSLKMLGILRGDFEDSVVDAVLGIWAPNLLNFILEAHLYGTCLLDVPSLRKATLAID...

XP_057772062.1
MDESQDSESGSLDRLSDLPDALILEILSLLWSREVVRTTILSKRWKDLWTTVPRFDFDFCDEDPNFIRGALVQWKAMEKQVEELAVYLMPPLSIEYYAPRRLCSCSSITRLCLSYCSMQIEENVQWNQLISLTLEHNDPVKVSAVTMNRILSGAPRLERLILQPLEVNENFYIRSTSLKMLGILRGDFEDSVVDAVLGIWAPNLLNFILEAHLYGTCLLDVPSLRKATLAIDDPPPLETFEQLLRSIRHVKKLTLSDECI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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