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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000536`

染色体: Chr07 坐标: 3715181-3716126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000536`
名称	SmilChr07G000536
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3715181 - 3716126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991720`
GeneID	`130991720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991720`
原始查询	`SmilChr07G000536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT3G52680` (AT3G52680) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824434] identity=32.3; qcov=0.89; evalue=2.51e-16; confidence=low
Rice	`Os07g0287000` (OsFbox367) - identity=37.7; qcov=0.586; evalue=2.82e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772065.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772065.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772065.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772065.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3715533`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A18,A22,B107,B109,B110,B118,B121,B128,B129,B132,B136,B139,B2,B3,B37,B38,B39,B40,B47,B77,B82,C24,C29,C31,C41,C43,C55,C81,C82,C9,D1
`Chr7:3715566`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A14,A15,A18,B1,B103,B130,B131,B47,B50,B84,B88,B94,C22,C27,C30,C50,C77
`Chr7:3715574`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B57,B91
`Chr7:3715574`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B57,B91
`Chr7:3715598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr7:3715622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B60,B77,C49,C6
`Chr7:3715645`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B129,B29,B45,B80,C30,C52,C63
`Chr7:3715646`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr7:3715646`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr7:3715648`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B129,B29,B45,B80,C30,C52,C63
`Chr7:3715704`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A4
`Chr7:3715704`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772065.1

181 aa

181

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF00646 F-box 13-53 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 72-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772065.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	53	3.9e-08	33.6	F-box domain
`XP_057772065.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	72	159	2.6e-06	27.8	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916082.1
CACTGCTCTCATTGTTGAAATCACATCTCAGAAAGTAGGTATTTTTTGAGTTTAATTTGAGCGCATAGTCATGTATTCCTGGCGGTCTCATGATCACCGTGATCGACTAAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATCCTCATGATTCTTTCACTGTTGGAGACGCGGTATGCTTTCACGACAACATTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTCTGGACCACCGTTCCCCGTCTGAAATTCGTCGAAGAAGGTAGAAATTTCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991720
ATGTATTCCTGGCGGTCTCATGATCACCGTGATCGACTAAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATCCTCATGATTCTTTCACTGTTGGAGACGCGGTATGCTTTCACGACAACATTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTCTGGACCACCGTTCCCCGTCTGAAATTCGTCGAAGAAGGTAGAAATTTCATTTGTGGAGTTGTTGCGAGATTTAGAGGTGTGAAGATCGTGAGCTTCTACCTTTCTTGGTTTGATCAGCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772065.1
MYSWRSHDHRDRLSELPDSLILMILSLLETRYAFTTTFLSKRWRDLWTTVPRLKFVEEGRNFICGVVARFRGVKIVSFYLSWFDQLPTSSDVDSWLLFAVEKQVEELYVDFEAHLDAHYCPPQCLYSCSSITELHLACCWLEIEGSVQWNRLKSLYLEVLNTSRVMMSLTNFSRVHLAWKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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