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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000538`

染色体: Chr07 坐标: 3721442-3723143 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000538`
名称	SmilChr07G000538
描述	F-box/LRR-repeat protein 25-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3721442 - 3723143 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991722`
GeneID	`130991722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991722`
原始查询	`SmilChr07G000538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein 25-like
产物	F-box/LRR-repeat protein 25-like
Arabidopsis	`AT5G22730` (AT5G22730) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832336] identity=27.5; qcov=1.05; evalue=2.06e-21; confidence=low
Rice	`Os08g0197000` (OsFbox420) - identity=29; qcov=0.495; evalue=1.69e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772068.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772068.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772068.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772068.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3721660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:3721671`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:3721671`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3721679`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:3721679`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3721710`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B25,B71,B91,C42,C83,D8
`Chr7:3721731`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B124,B26,B36,B93,C25,C53,D11
`Chr7:3721734`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B100,B123,B139,B42,B43,B48,B57,B85,B97,C32,C38
`Chr7:3721742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C42,C83
`Chr7:3721771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C42,C83
`Chr7:3721771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C83
`Chr7:3721785`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A10,A23,B126,B25,B59,B71,C16,C62,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772068.1

432 aa

216

432

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 10-50 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 69-396 aa PF24758 LRR_At5g56370 89-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772068.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	10	50	3.1e-08	33.9	F-box domain
`XP_057772068.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	69	396	2e-09	38.1	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772068.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	89	223	7.1e-11	42.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916085.1
AATCACATCTTAGAAAGTAGGGCTTTTTGAGTTTAATTTGAGTGCATAGTTAAACAAGTAGCAATGGATTCCTGGCAGTCTCATGATCGACTAAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCACTGTTGGATACGCGGTATGCTGTTAGAACAACATTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTTTGGACCATCGTTCCCCGCTTGAAATTTGAATATGAACATCCAGATTTTATTTGTGGAGTTGTTGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991722
ATGGATTCCTGGCAGTCTCATGATCGACTAAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATTCTTGAGATTCTCTCACTGTTGGATACGCGGTATGCTGTTAGAACAACATTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTTTGGACCATCGTTCCCCGCTTGAAATTTGAATATGAACATCCAGATTTTATTTGTGGAGTTGTTGCGAAATGGAGAGGTGTGAAGTTGGTGAGATTCTACCTTAGTTTGGACTATTGGAGTCCTACTAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772068.1
MDSWQSHDRLSELPDSLILEILSLLDTRYAVRTTFLSKRWRDLWTIVPRLKFEYEHPDFICGVVAKWRGVKLVRFYLSLDYWSPTRDIDPWLLFAVEKQVEELHVGWLSRIFDITYFPPQCLYSCSSLTELDLSYCWFKIEGTVHWNRLKSLCIFVNHLGDDAMNKLLLGAPRLEEMSLFIYEIDEDLCIRSISLKNLKIDCKDRKAILRIWAPNLLTLEIGENVIGGGDCLFYVPSLTEAFFTYVYDHHPSSPLPLESF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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