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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000539`

染色体: Chr07 坐标: 3723406-3725146 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000539`
名称	SmilChr07G000539
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3723406 - 3725146 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991723`
GeneID	`130991723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991723`
原始查询	`SmilChr07G000539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT5G02930` (AT5G02930) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831737] identity=26.3; qcov=0.993; evalue=3.79e-20; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=27.7; qcov=0.722; evalue=4.12e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772069.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772069.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772069.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772069.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3723523`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	26	A11,A2,A3,A5,B104,B112,B13,B35,B45,B48,B65,B69,B7,B74,B8,B93,C12,C27,C28,C37,C5,C58,C65,C74,C86,D5
`Chr7:3723585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B122,C27,C4,C7
`Chr7:3723601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B25,B71,B91,D8
`Chr7:3723643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C66
`Chr7:3723693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3723716`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr7:3723716`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr7:3723793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:3723819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:3723820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B26,B76,C25,C53
`Chr7:3723842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C12
`Chr7:3723851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C85,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772069.1

425 aa

212

425

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-58 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 78-397 aa PF24758 LRR_At5g56370 100-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772069.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	58	0.00036	21.1	F-box domain
`XP_057772069.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	78	397	6.4e-11	43.0	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772069.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	100	336	1.4e-11	45.2	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916086.1
GGCTAGTTTTGAGCCCTAGCTAGTCAAACAATGGATCAATCGCAGGAATCCGAACCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATTCCTTAATTCTTGAGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCCTCGATTCGAGATGTTGTTAGGACAACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCCGCTTTAAATATGATTTCCGTGATGAAGATCCAAACTTTATCCGTGGGGCTCTGGTACAATGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991723
ATGGATCAATCGCAGGAATCCGAACCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATTCCTTAATTCTTGAGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCCTCGATTCGAGATGTTGTTAGGACAACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCCGCTTTAAATATGATTTCCGTGATGAAGATCCAAACTTTATCCGTGGGGCTCTGGTACAATGGAAAGGTGCCAAGATTCTCGATTTTAGCTTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772069.1
MDQSQESEPGSLDRLSDLPDSLILEILSLLSSSIRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPRFKYDFRDEDPNFIRGALVQWKGAKILDFSLCFIHNDPPSSDIIDSLLLLAMEKQVEELTVDLKPSMSMEYYAPQRLYSCSSITRLCLSYCSVQIKENVQWNQLVSLTLEHVDSVKVSSVTMSQILSGAPRLEQLILWPLEVNEDFYIVSTSLKFLEIGLGDYNHSVVYEILGIWAPNLLFLEFSGDIYGICFLDVPSLTHARLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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