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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000540`

染色体: Chr07 坐标: 3727964-3729763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000540`
名称	SmilChr07G000540
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3727964 - 3729763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991724`
GeneID	`130991724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991724`
原始查询	`SmilChr07G000540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT4G13965` (AT4G13965) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031] identity=29.4; qcov=0.639; evalue=2.94e-16; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=26.7; qcov=0.865; evalue=8.1e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772070.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772070.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772070.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772070.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3728058`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr7:3728058`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr7:3728076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:3728081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C76
`Chr7:3728083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B93,C2,C8
`Chr7:3728091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,D9
`Chr7:3728098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C27
`Chr7:3728113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B95,C48
`Chr7:3728180`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr7:3728180`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr7:3728245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C2,C8
`Chr7:3728264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C39,C46,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772070.1

399 aa

200

399

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 15-57 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 77-371 aa PF24758 LRR_At5g56370 79-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772070.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	15	57	0.00038	21.0	F-box domain
`XP_057772070.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	77	371	9e-11	42.5	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772070.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	79	307	9.2e-09	36.0	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916087.1
TAAAGGCCCAAAGATTTGGCGGTATAATGTGAAAACCCTTCTTCCCCAATTTTGAAAGAAGTGGCTAGTTTTGAGCCCTAGCTACTCAAAAAATGGATGAATCGCAGGATTCCGAATCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATGCCTTAATTCTTGAGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGTCGATTCGTGATGTAGTTAGGACTACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991724
ATGGATGAATCGCAGGATTCCGAATCAGGCAGCCTCGATCGACTGAGCGACTTACCCGATGCCTTAATTCTTGAGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGTCGATTCGTGATGTAGTTAGGACTACTATTCTCTCGAAACGTTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCCGCTTTGATTTTGATTTTTGTGATGAAGATCCAAACTTTATCCGTGGGGCTCTTGCACAATGGAAAGCCATGGAAAAACAAGTGGAAGAGCTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772070.1
MDESQDSESGSLDRLSDLPDALILEILSLLSSSIRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPRFDFDFCDEDPNFIRGALAQWKAMEKQVEELTVNLKSSMSIEYYVPHHLYSCSSISRLCLSYCSVQIEENVQWNQLRSLTLEHADSVKVSSVTMSQILSAAPRLEQLILRPLEVTEDFYIVSTSLKFLEIGHGEYNHSVVYEILGIWAPNLLFLEFSGDVYGTCFLDVPSLTRARLDFMDEPPPLVTFDHLLWSIRHVTDLTLSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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