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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000545`

染色体: Chr07 坐标: 3752266-3754678 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000545`
名称	SmilChr07G000545
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3752266 - 3754678 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991728`
GeneID	`130991728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991728`
原始查询	`SmilChr07G000545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT5G56820` (AT5G56820) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835784] identity=26.1; qcov=1.04; evalue=5.45e-22; confidence=low
Rice	`Os01g0595700` (OsRALyase1) - identity=34.7; qcov=0.332; evalue=3.27e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772076.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772076.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772076.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772076.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3752512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:3752536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C55
`Chr7:3752543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:3752578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B41,C16
`Chr7:3752606`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	138	A1,A10,A11,A14,A18,A19,A2,A21,A23,A3,A7,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B109,B11,B110,B114,B119,B120,B123,B125,B126,B127,B128,B131,B134,B137,B14,B15,B18,B20,B22,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B4,B42,B45,B49,B51,B54,B57,B58,B6,B62,B63,B67,B68,B69,B7,B70,B75,B79,B81,B83,B86,B87,B89,B90,B91,B93,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C41,C42,C43,C45,C46,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C69,C7,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C80,C83,C84,C86,D1,D10,D2,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:3752609`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	129	A1,A10,A11,A18,A19,A2,A20,A23,A3,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B109,B11,B110,B114,B117,B119,B120,B125,B126,B127,B128,B131,B134,B137,B14,B15,B18,B22,B30,B31,B32,B34,B35,B4,B42,B45,B49,B51,B54,B57,B58,B6,B62,B63,B68,B69,B7,B70,B75,B78,B79,B81,B83,B86,B87,B89,B90,B91,B93,B94,B96,B98,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C45,C46,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C61,C63,C64,C65,C69,C7,C70,C72,C73,C75,C76,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C86,D10,D5,D7,D8,D9
`Chr7:3752610`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	74	A13,A15,A2,A20,A24,A5,A6,B10,B105,B108,B110,B112,B117,B118,B130,B133,B136,B137,B140,B16,B17,B18,B23,B26,B31,B38,B39,B4,B40,B52,B6,B65,B68,B72,B75,B78,B8,B83,B88,B9,B90,B92,B97,C12,C17,C2,C24,C28,C3,C32,C33,C37,C39,C40,C5,C51,C54,C57,C58,C61,C64,C65,C67,C70,C71,C77,C81,C82,C83,C86,C87,D1,D4,D6
`Chr7:3752611`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B104,B28,B80,B87,C55,C7,D6
`Chr7:3752617`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B104,B28,B80,B87,C55,C7,D6
`Chr7:3752636`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B107,B39,B56,B74,B75,B9,C24
`Chr7:3752638`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B107,B39,B56,B74,B75,B9,C24
`Chr7:3752656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772076.1

434 aa

217

434

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 13-53 aa PF24758 LRR_At5g56370 89-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772076.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	53	5.6e-06	26.8	F-box domain
`XP_057772076.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	89	234	2.1e-11	44.6	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916093.1
TACTCTCTTGCTTGTGCTCTGCTCTCTCTCATCTCAATACATTTACTTTCCCACTTTACTCGGAAATTCTTATATTCTTCACAGAGAAATGGAACTGAATGAATCAATTTCTTCCTCGAGCCTTTTTGATCAACAAGCGGGTAAGATGTAAGTCGCTTCTTCTGGTGATCTCATTGTTGTGCGCTGCTGCTATCTCTCAATAGTTGAAACCACATCTTAGAAAGTAGGTCTGTTTGAGTGCACAGTTAAACAAGTAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991728
ATGGATTCGTGGCAGTCTTATGATCACCGTGATCGGCTAAGTGCGTTACCGGACTCCTTAATCCTCATGATTCTTTCACTGTCGGAAACGGTGGATGCTGTTAGGACAACAGTTCTCTCCAAACGTTGGAGAGATCTTTGGACCACCGTTCCCCGTCTGAAATTTGTACGTGGTAATCGACATTTTATTCGTCAAGTTCTCGCAAAATGGAGAGGTGCGAAGATCGTGAGCTTCTACCTTTCTGTTCGGAGTCATCCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772076.1
MDSWQSYDHRDRLSALPDSLILMILSLSETVDAVRTTVLSKRWRDLWTTVPRLKFVRGNRHFIRQVLAKWRGAKIVSFYLSVRSHPSDLASWMLFVAEKQVEELYIDFGPHTHADFYPPQRLYSCSSITELHLGLCCWLEIEGSVQWNRLKSLYIQVPDSSCYDAIRKILVAAPLLEEMTLFIGKINENLTIRSTSLKKLSILNHWMVNADIMAMLRIEAPNLLTLQIWGANVVNGGSFLFDVPSLTEASFSRFCEEYDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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