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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000546`

染色体: Chr07 坐标: 3773118-3774870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000546`
名称	SmilChr07G000546
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g22670
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3773118 - 3774870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991729`
GeneID	`130991729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991729`
原始查询	`SmilChr07G000546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g22670
产物	putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g22670
Arabidopsis	`AT5G22670` (AT5G22670) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832330] identity=25.8; qcov=0.998; evalue=1.3e-23; confidence=low
Rice	`Os01g0595700` (OsRALyase1) - identity=27.6; qcov=0.594; evalue=3.35e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772077.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772077.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772077.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772077.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3773198`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A2,A8,D8
`Chr7:3773198`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A2,A8,D8
`Chr7:3773203`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A2,A8,C11,D8
`Chr7:3773203`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A2,A8,C11,D8
`Chr7:3773205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B33,B53
`Chr7:3773243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A8,B71,C11,D8
`Chr7:3773296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B93
`Chr7:3773347`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,A15,B103,B129,B130,B131,B135,B48,B64,B69,B73,B82,B84,B9,B94,C12,C29,C43,C86,C9,D1
`Chr7:3773354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:3773365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr7:3773383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B90,C47,C65
`Chr7:3773415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772077.1

446 aa

223

446

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 21-59 aa PF24758 LRR_At5g56370 100-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772077.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	21	59	2.8e-05	24.6	F-box domain
`XP_057772077.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	100	252	3.8e-14	53.6	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916094.1
TTCCTGACTTATAGTCTATTTCAATTCCAAGAATATTTTGTTACGAAACAAAGATAGTTTGAGCTTTGAGTTCAAAAATGGTTGATGGTTCAGAACGTAACGAGGTTGCAGTTGCAGAGTCCAACGACGTCGATCGACTCAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATCTTCACGATTTTTTCGTTGTTGGAATCGCGAGATGTTGTTAGCACAACCTTCCTCTCCAAAAGATGGAAAAATCGGTGGGCCACCGTCCCCTGCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991729
ATGGTTGATGGTTCAGAACGTAACGAGGTTGCAGTTGCAGAGTCCAACGACGTCGATCGACTCAGTGAGTTACCCGACTCCTTAATCTTCACGATTTTTTCGTTGTTGGAATCGCGAGATGTTGTTAGCACAACCTTCCTCTCCAAAAGATGGAAAAATCGGTGGGCCACCGTCCCCTGCCTTGCCTTCCGGAATAATTTACCAAGGTTTATTTACGGTGCTCTCACGCAATGGAGAGGCCCCAATTTTCTCAAACTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772077.1
MVDGSERNEVAVAESNDVDRLSELPDSLIFTIFSLLESRDVVSTTFLSKRWKNRWATVPCLAFRNNLPRFIYGALTQWRGPNFLKLTIAFTNFLPRANDLNSWLLFAIAKQVEELSIHLGLLRIGASATPYSPPQRFYSCSSFRKLSLSHLRLQIEGNNVQWGQLKSLTIVGSNSLSAYAINRILCGAPRLEELNLCIREIGGRFTIQSTSLKTLCIGRQDDCFEIVEVYLGSILVIDAPNLSSLVILSRCYGRCLLNVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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