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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000547`

染色体: Chr07 坐标: 3776770-3777255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000547`
名称	SmilChr07G000547
描述	putative F-box protein At2g39415
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3776770 - 3777255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993073`
GeneID	`130993073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993073`
原始查询	`SmilChr07G000547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At2g39415
产物	putative F-box protein At2g39415
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=33.6; qcov=0.832; evalue=3.88e-12; confidence=low
Rice	`Os04g0440400` (OsFbox212) - identity=36.2; qcov=0.789; evalue=2.38e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773777.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773777.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773777.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773777.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3776785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B20,C42,C79,C8
`Chr7:3776833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A3,B121
`Chr7:3776917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B54,B84,C27,C69
`Chr7:3776953`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A21,A23,A3,A5,B104,B113,B118,B43,B54,B58,B84,B88,B95,C2,C27,C28,C29,C34,C37,C41,C48,C52,C57,C69,C7,C73,C74,C77,C82,C83,C84,C86,D2,D7
`Chr7:3776993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A23,A3,B104,B113,B43,B88,C2,C28,C37,C41,C52,C57,C7,C73,C74,C77,C83,C84,C86,D2,D7
`Chr7:3777010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A15,A20,B123,B130,B135,B14,B44,B48,B52,B64,B69,B84,B85,B90,C2,C29,C41,C46,C65,C86
`Chr7:3777048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr7:3777074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:3777080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,B107,B140,B18,B23,B75,B97,C24,C54,C82,D4,D6
`Chr7:3777091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B26
`Chr7:3777091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:3777113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773777.1

161 aa

161

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 24-58 aa PF00646 F-box 24-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773777.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	24	58	1.4e-05	25.4	F-box-like
`XP_057773777.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	24	64	0.00024	21.6	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917794.1
ATGGCTTCTTCGCACTTTCCTCGGATTCGTCTTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTTTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTCTCCAAACGCTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCTGCCTTGAGTTCGAAGACGAAAATCCTGAGTTTATTTGTAGGGTTCTTGCACAATGGCGAGGTGCCAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993073
ATGGCTTCTTCGCACTTTCCTCGGATTCGTCTTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATAGCCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTTTCGATTCTTTCGTTGTTGTCGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTCTCCAAACGCTGGAAAGATCTCTGGACCACCGTCCCCTGCCTTGAGTTCGAAGACGAAAATCCTGAGTTTATTTGTAGGGTTCTTGCACAATGGCGAGGTGCCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773777.1
MASSHFPRIRLSEHNEVSDSLDRLSELPDSLILSILSLLSSTRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPCLEFEDENPEFICRVLAQWRGAKIWIFYLSLSDEVPHLPPPTSSDVESWLLFAVEKQVEAHMYVFISHTAHLRVCIHAPPLQHYTFNIVPWKSRGLCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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