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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000549`

染色体: Chr07 坐标: 3786279-3790840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000549`
名称	SmilChr07G000549
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3786279 - 3790840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991732`
GeneID	`130991732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991732`
原始查询	`SmilChr07G000549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT5G56440` (AT5G56440) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835745] identity=28.4; qcov=0.937; evalue=2.97e-24; confidence=low
Rice	`Os10g0128200` (OsFbox517) - identity=27.3; qcov=0.676; evalue=1.94e-12; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772081.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772081.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772081.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772081.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3786426`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A1,A6,B107,B140,B18,B23,B75,B97,C24,C27,C4,C54,C7,C82,D4
`Chr7:3786452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:3786495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:3786578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:3786587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,B83,B95,C36
`Chr7:3786644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C2
`Chr7:3786656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C33,C46,C5,C8,C82
`Chr7:3789520`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B5,C17,C60
`Chr7:3789520`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B5,C17,C60
`Chr7:3789525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B40,B44,B71,D3
`Chr7:3789533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B39
`Chr7:3789551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772081.1

444 aa

222

444

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 107-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772081.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	107	240	6.4e-12	46.3	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916098.1
CCTTCCTCGCAATGGCTTGCTCCCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATAAGCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTTTCGATTCTTTCGTGCTTGTGGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTGTCGAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACAGTCCCCTGCCTTGAGTTCGATGACGAAAATCAAGAGTTTATTAGTGGGGTTCTTGCACAATGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991732
ATGGCTTGCTCCCACTTTCCTCAGCTTCATGGTTCCGAACATAACGAGGTTTCCGATAAGCTCGATCGACTGAGTGAGTTGCCCGATTCCTTAATCCTTTCGATTCTTTCGTGCTTGTGGTCGACGAGAGATGTTGTTAGGACAACCATTCTGTCGAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACAGTCCCCTGCCTTGAGTTCGATGACGAAAATCAAGAGTTTATTAGTGGGGTTCTTGCACAATGGAGAGGTGCCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772081.1
MACSHFPQLHGSEHNEVSDKLDRLSELPDSLILSILSCLWSTRDVVRTTILSKRWKDLWTTVPCLEFDDENQEFISGVLAQWRGAKIERFCFLCLSDEVPPPTRSDVESWLLFAMEKQVEDLHIYTNVPYCPPQSLYSCSSITTLDLQYCSLEIDGSVQWNQLKNLSIQNPYSLSADAISKLLSGAPHLEYLTLTTLDIDGNFDIVSPRLKTLLIEEAGIYGELTIRAPNLLTLEILASIYNGSSVLCHVPSLTKACIEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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