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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000569`

染色体: Chr07 坐标: 3875018-3880669 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000569`
名称	SmilChr07G000569
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3875018 - 3880669 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991743`
GeneID	`130991743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991743`
原始查询	`SmilChr07G000569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=28; qcov=0.976; evalue=8.96e-78; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.8; qcov=0.96; evalue=1.34e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772101.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772101.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772101.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772101.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3878047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C32,C68
`Chr7:3878047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:3878092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C21
`Chr7:3878208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:3878233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B69
`Chr7:3878233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:3878268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C83
`Chr7:3878366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B72
`Chr7:3878383`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C33,C46
`Chr7:3878383`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:3878394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C27
`Chr7:3878595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772101.1

841 aa

420

841

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 135-307 aa PF23559 WHD_DRP 392-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772101.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	135	307	2.8e-40	138.4	NB-ARC domain
`XP_057772101.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	392	454	2.1e-10	41.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916118.1
AGAAGAAATGGCCTACAATCTTCAATCCCTCATCACAATCTTACAACAAATCTTGAATCCTGAACAAACACGTTGGATTGTTGATCACAACAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCACAAAATCTGTTTCTCTGAAGCAGATTCTTGAAAACTCTCCACTCCCCAAAGCAGAAACTAGTTTGGAGAGTGAAATCCGTGATGCAGCACACGAAGCAGAAGATATGATAGAATCTCACATGGTCGATCAAATGCTTTCGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991743
ATGTGCTCTCAGGAAATCCTGAAACCTGATCAAAAGCGATGGGATTTTGATGACGTTCAACCACAACTAAAATCCCTCCTAGAAATATCAGCATCTTTGAAGCAGATTCTTGAAAAATCTGTTGTGGCAAGTGGCCCCAAAATGGAAAGATTAGAGAGTCAAATCCAAGATGCAGCACATGAAGCAGAGGACATCATCGAATCCCACATGGTCAATCAGGTGATACCTGAAAGCTCGAGCTTCACAATTTACCCACCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772101.1
MCSQEILKPDQKRWDFDDVQPQLKSLLEISASLKQILEKSVVASGPKMERLESQIQDAAHEAEDIIESHMVNQVIPESSSFTIYPPDLEQVIQQLHSVMSFVNGIQISRTSSSVAAAAVASSFSPAKNTVVGLDQDLMELMDRLRGQESRLEIIPILGMGGIGKTTLARTLYNDQSIASHFDICAWTTISQEYNVRAMLLGLLSCINKELITPDLLKEEDNVLKDVIYKNLYARRYLIVLDDMWSADSWNSVRRCFPDND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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