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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000574`

染色体: Chr07 坐标: 3898774-3902854 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000574`
名称	SmilChr07G000574
描述	uncharacterized SmilChr07G000574
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3898774 - 3902854 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991747`
GeneID	`130991747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991747`
原始查询	`SmilChr07G000574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0273800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0273800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G02340` (AT4G02340) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828063] identity=56.6; qcov=0.994; evalue=5.28e-144; confidence=high
Rice	`Os05g0273800` - identity=61.1; qcov=0.976; evalue=3.85e-147; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF07224 (Chlorophyllase); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772106.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772106.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772106.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772106.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772106.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:3898949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C45
`Chr7:3898955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B16,B86,B91,C76
`Chr7:3899066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:3899349`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B35,C2
`Chr7:3899349`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B35,C2
`Chr7:3901646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:3901715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B25,B71,C42,D8
`Chr7:3901796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:3901806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B48
`Chr7:3902428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772106.1

329 aa

164

329

Chlorophyllase

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF07224 Chlorophyllase 19-119 aa PF00561 Abhydrolase_1 25-304 aa PF12146 Hydrolase_4 26-144 aa PF12697 Abhydrolase_6 27-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772106.1`	Pfam	`PF07224`	Chlorophyllase	Family	19	119	1.3e-08	34.7	Chlorophyllase
`XP_057772106.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	25	304	2.2e-22	80.6	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057772106.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	26	144	2.5e-11	44.1	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057772106.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	27	309	4.6e-22	80.4	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916123.1
GCCATGGGCCCATGGCCTATATATAATCTCAGCCCGAATTGCACTCATCAAAAGAGTTTGACGAGTGCATTTTATTTAACACTTTTCAACACCCTAAATTATAGATAATCTCACCTCAATTCGACACGCACACACCAAAAATGGAGCAAATTGAGCACAAATCACTGAGCCTTAACGGGCTCAACATGCACGTGGCAGAAGCGGGCCAGGGCCCGATCATCCTCTTCCTCCACGGCTTCCCGGAATGCTGGTACACGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991747
ATGGAGCAAATTGAGCACAAATCACTGAGCCTTAACGGGCTCAACATGCACGTGGCAGAAGCGGGCCAGGGCCCGATCATCCTCTTCCTCCACGGCTTCCCGGAATGCTGGTACACGTGGCGCCACCAGCTGGCATTCTTCGCCGGTCATGGCTACCGCGCCGTGGCGCCGGACCTCCGCGGCTACGCCGACACGACAGGCGCGCCGGCGAGTGATCCGGCGAAATTCACCACGCTGCACGTAGTCGGGGACCTGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772106.1
MEQIEHKSLSLNGLNMHVAEAGQGPIILFLHGFPECWYTWRHQLAFFAGHGYRAVAPDLRGYADTTGAPASDPAKFTTLHVVGDLVALIDAAAPPGEKVFVVGHDWGALIAWALCLYRPDKVRALLNLSVAFSRRSPIKKPIETLRSFYGDEYYIIRFQEPGQIEHEFAQIGTKNVLKNLLTYRNPGPLYLPKDKAFPDTPITSPSWLSEEDLDYYATKYDAAGFTGALNYYRALDINWELTAAWTGSKIQVPVKFVVGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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