当前解析结果
SmilChr07G000582| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000582 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000582 |
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 15 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 3976897 - 3977798 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991925 |
|---|---|
| GeneID | 130991925 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991925 |
| 原始查询 | SmilChr07G000582 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 15 |
| 产物 | FCS-Like Zinc finger 15 |
| Arabidopsis | AT5G49120 (AT5G49120)DUF581 family protein, putative (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834971] identity=40.6; qcov=1.17; evalue=1.08e-25; confidence=medium |
| Rice | Os02g0592833- identity=52.1; qcov=0.712; evalue=5.11e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04570 (zf-FLZ) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991925 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772362.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057772362.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772362.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772362.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772362.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:3977071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B80,C13,C34,C56 |
Chr7:3977086 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:3977220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C44,C47,C59,D3 |
Chr7:3977424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B65,D6 |
Chr7:3977443 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr7:3977482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,B64 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772362.1PF04570
zf-FLZ 39-86 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772362.1 |
Pfam | PF04570 |
zf-FLZ | Domain | 39 | 86 | 1e-22 | 80.0 | zinc-finger of the FCS-type, C2-C2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。