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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000585`

染色体: Chr07 坐标: 4000171-4002213 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000585`
名称	SmilChr07G000585
描述	uncharacterized SmilChr07G000585
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4000171 - 4002213 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991854`
GeneID	`130991854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991854`
原始查询	`SmilChr07G000585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vitellogenin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241205]; symbol=AT3G06868; hit=AT3G06868; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	vitellogenin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241205]; symbol=AT3G06868; hit=AT3G06868; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G06868` (AT3G06868) vitellogenin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241205] identity=40; qcov=1.07; evalue=3.75e-62; confidence=medium
Rice	`Os02g0526700` - identity=36.1; qcov=1.01; evalue=9.33e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772251.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772251.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772251.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772251.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4000762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C86
`Chr7:4000783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:4000810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B117,B72,C43,C83
`Chr7:4000819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B7,C64,C66
`Chr7:4000893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr7:4000927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:4000944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B7,C64,C66
`Chr7:4000960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B48
`Chr7:4001081`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B35,B5,C71,C74,C82
`Chr7:4001081`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B35,B5,C71,C74,C82
`Chr7:4001330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D6
`Chr7:4001488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916268.1
TCCAAATTCTGATTTGAAGCGATTTATCTCTCTCTCTTGGTTAAATCTATTAATCTAGATTCTGGAGAGCCCCAAACAAGGCCCAAGAGAGTGGCGCTAAGAACAATTAGGGTTTCGGTTGTCTTGTTCGGTTGTCAGAAGTTAATTGCATAAACAAGTCTGCTTTCCACGTGCTTCTGGGGACTCTCTCCTTCACTCTCCATCCCCCACTTACTTCAATGCCATTCCTTTCATTTCTCTCTCTCTCTACACCTCATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991854
ATGGTGATGGAGGTGGTGCATGAAGATATGGGGGAAGGCAGCATGCAATGCACGAACCACCCATACAAAAACAGCACTCCAGGTGGGATCTGCGCCTTCTGCCTTCAAGAAAAGCTCGGGAAACTCGTCTCCTCGTCCTTCCCCGTTGCCATCTTCCCTTCCTCCTCGTCTTCCTCCTCCTCTAGATCTGATTTCGGCGCCGCCGCCGTCGGCGACGCTGCCCTCCAGCCCCGCCCCCTGGCCGCCGTCTCCGCCAACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772251.1
MVMEVVHEDMGEGSMQCTNHPYKNSTPGGICAFCLQEKLGKLVSSSFPVAIFPSSSSSSSSRSDFGAAAVGDAALQPRPLAAVSANASENASSGECNYYSRRSRLPFVLTQKKKKKKDGGGVAVGSSDSGSIVFKRSKSTATPRRGMHFLDENFSDDYSPHRRGFWSFLYMSKPSSVKKSEKSLKDLNFTTPTSSSTVGSSSVNGGGGGSGGIRAREKKREDFVVVDENGSPDQAAFDRKVSRSRSVGCGSRSFSGDFFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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