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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000588`

染色体: Chr07 坐标: 4016012-4017238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000588`
名称	SmilChr07G000588
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4016012 - 4017238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993079`
GeneID	`130993079`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993079`
原始查询	`SmilChr07G000588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G10920` (LOV1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837635] identity=29.9; qcov=1; evalue=9.43e-45; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=35; qcov=0.958; evalue=1.24e-51; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993079

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773784.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057773784.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773784.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773784.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4016013`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B29,B33,B63,B64,B89,C66,C75,C76
`Chr7:4016015`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B29,B33,B63,B64,B89,C66,C75,C76
`Chr7:4016039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:4016040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:4016066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C2,C84
`Chr7:4016066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C84
`Chr7:4016119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:4016157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C71
`Chr7:4016157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:4016161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B32,B65,D6
`Chr7:4016163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A23,A5,B106,C58
`Chr7:4016179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773784.1

408 aa

204

408

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 14-112 aa PF23559 WHD_DRP 179-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773784.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	14	112	1.4e-25	90.6	NB-ARC domain
`XP_057773784.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	179	249	4.1e-20	72.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917801.1
ATGAAGGCAATTTTATTAGGCCTTATTCGTTGCATAATTGGAAAAGAATGTGACCAACATAATGAAAAGGGAGATGGCGAGTTAAAAGATATCTTGTATAGGCGGTTGTACGGTAGAAGATACATGATTGTATTAGATGATATTTGGAGCACAAGATTCTGGGATGAGATAAGGATGTACTTCCCAGACAACAACAATAGGTGTCGCATTGTGATCACCACCAGGGAATCCAACATGGCCAAATATGCGGACTCGAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993079
ATGAAGGCAATTTTATTAGGCCTTATTCGTTGCATAATTGGAAAAGAATGTGACCAACATAATGAAAAGGGAGATGGCGAGTTAAAAGATATCTTGTATAGGCGGTTGTACGGTAGAAGATACATGATTGTATTAGATGATATTTGGAGCACAAGATTCTGGGATGAGATAAGGATGTACTTCCCAGACAACAACAATAGGTGTCGCATTGTGATCACCACCAGGGAATCCAACATGGCCAAATATGCGGACTCGAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773784.1
MKAILLGLIRCIIGKECDQHNEKGDGELKDILYRRLYGRRYMIVLDDIWSTRFWDEIRMYFPDNNNRCRIVITTRESNMAKYADSKSLQHQVQLLNKSEGWNLFRRIVFGEEDGPLLAISVIGGLLSKVGRSKDVWENIGNNVRAAIGESDKQFSNILSLSYNHLPLHLKPCFVYMAAFPEDYEIKPSRLICIWIAEGFAKLNEDKSLEEEAEDYLKSLMERNLVSVRSYHWYGKAKRYNMHDLLRDLCMKKVVDEKFLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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