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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000621`

染色体: Chr07 坐标: 4205383-4208679 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000621`
名称	SmilChr07G000621
描述	vesicle-associated membrane protein 724
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4205383 - 4208679 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991894`
GeneID	`130991894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991894`
原始查询	`SmilChr07G000621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated membrane protein 724
产物	vesicle-associated membrane protein 724
Arabidopsis	`AT4G15780` (VAMP724) vesicle-associated membrane protein 724 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827258] identity=81.6; qcov=0.817; evalue=4.83e-111; confidence=high
Rice	`Os07g0249200` (P0021G06.107) - identity=67.6; qcov=1.03; evalue=8.17e-102; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00957 (Synaptobrevin); PF13774 (Longin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057772326.1`
2	Endosome	内体	1.00000	`XP_057772326.1`
3	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057772326.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057772326.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.60000	`XP_057772326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4205809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B66,B96
`Chr7:4205813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4207303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B65,C74
`Chr7:4207367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C36
`Chr7:4207377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:4207416`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B122,B96,C14,C37,C85
`Chr7:4207416`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B122,B96,C14,C37,C85
`Chr7:4207421`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A19,B1,B110,B13,B16,B65,C51,C74
`Chr7:4208361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772326.1

219 aa

110

219

Longin

Synaptobrevin

PF13774 Longin 18-112 aa PF00957 Synaptobrevin 131-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772326.1`	Pfam	`PF13774`	Longin	Domain	18	112	9.8e-23	80.9	Regulated-SNARE-like domain
`XP_057772326.1`	Pfam	`PF00957`	Synaptobrevin	Domain	131	210	5.6e-26	91.0	Synaptobrevin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916343.1
GGCGATTCAAAAAAAGAAATTAAAAACAATTATTTCACTCGGTATTAATGTATTATAATGTGGAAATCATAATTAATATAAACGACATTATAATTATAAAATACCACACCCGTCACCCGTGGTTCATTGATTCTATATAACAAAGTTTACAGCATAGAAAAATAAATAAATACAACAACAAATTTAAAATACATTAAAACGAAAGCAAGAAAGTAATCGAAAAAAACCAGCAGCTGCCAATCAGAAGCAGCCCACCACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991894
ATGGGCCAGGAATCGTTCATATACAGCTTCGTGGCGCGTGGCACGATGGTGCTGGCGGAGTACACCGAGTTCACCGGCAATTTTCCGGCGATCGCAGCTCAGTGCTTGCAGCGGCTGCCGTCGACCAACAACAAGTTCACATACAACTGTGATCACCACATTTTTAACTTTTTAGTTGAAGATGGATACGCTTACTGCGTCGTTGCCAAAGAATCCGTAGGGAAACAGATCTCAATCGCACTTTTGGAACGCATTAAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772326.1
MGQESFIYSFVARGTMVLAEYTEFTGNFPAIAAQCLQRLPSTNNKFTYNCDHHIFNFLVEDGYAYCVVAKESVGKQISIALLERIKADFRKRYGGGKADTAVAKSLNKEFGPLMKEHMQYIIDHADEIEKLLKVKAQVSEVKSIMLENIDKTIERGQNLTDLNDKAQDLRESAQVFKKQGTQIRRKMWYQNMKIKLVVLGILLLLILIIVLSICRGFNC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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