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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000634`

染色体: Chr07 坐标: 4279586-4282114 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000634`
名称	SmilChr07G000634
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4279586 - 4282114 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993084`
GeneID	`130993084`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993084`
原始查询	`SmilChr07G000634`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=28.5; qcov=0.97; evalue=6.45e-76; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.7; qcov=0.955; evalue=1.21e-83; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993084

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773790.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057773790.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773790.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773790.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773790.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4279586`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:4279586`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4279660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:4279690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:4279723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B123,B45
`Chr7:4279727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:4279752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B87,B89
`Chr7:4279786`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C33
`Chr7:4279786`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C33
`Chr7:4279797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:4279803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B14,B64
`Chr7:4279803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773790.1

842 aa

421

842

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 145-318 aa PF23559 WHD_DRP 401-470 aa PF23598 LRR_14 516-708 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773790.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	145	318	1.4e-45	155.7	NB-ARC domain
`XP_057773790.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	401	470	3.2e-21	75.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057773790.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	516	708	3.2e-15	56.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917807.1
ATGGCCTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAACCCTGATCAACAATCATGCTGGGTTCTTGATCACAACAAACCACAACTTGAATCCCTCCTTGAAAAAGCTGCTTCTCTGCAGCATATTCTTGAAAAAACCTTGCACCCCAAAATAGAAGGTTTAGAGAGTCAAATTAGAGAAGCAGCACATAAAGCAGAAGATATCATTGAATCGCGCATGGTTGATCAAATCCTTTCCAGTCCTCAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993084
ATGGCCTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAACCCTGATCAACAATCATGCTGGGTTCTTGATCACAACAAACCACAACTTGAATCCCTCCTTGAAAAAGCTGCTTCTCTGCAGCATATTCTTGAAAAAACCTTGCACCCCAAAATAGAAGGTTTAGAGAGTCAAATTAGAGAAGCAGCACATAAAGCAGAAGATATCATTGAATCGCGCATGGTTGATCAAATCCTTTCCAGTCCTCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773790.1
MAYNLQPLITILQQILNPDQQSCWVLDHNKPQLESLLEKAASLQHILEKTLHPKIEGLESQIREAAHKAEDIIESRMVDQILSSPQGVSFTFSTPDLQQVMQQLDSVMEQIVKLVQEKMMPSGSSSSDASSLQDSSSKSVVVGVDKDMMQLKDRLTRMQSKLEIVPIVGMGGIGKTTLAQNLYEDPSIVSHFSYIAWVTISQDYDMRAILLTLIRCIIGKQCDQHNGKGDGELKDILYRSLYGRRYMIVLDDIWSNKFWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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