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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000636`

染色体: Chr07 坐标: 4290674-4293241 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000636`
名称	SmilChr07G000636
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4290674 - 4293241 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993085`
GeneID	`130993085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993085`
原始查询	`SmilChr07G000636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-8
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=28.4; qcov=0.708; evalue=1.67e-48; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.5; qcov=0.662; evalue=6.36e-46; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057773792.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773792.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773792.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773792.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4290999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B6,B88
`Chr7:4291006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B138,C39
`Chr7:4291036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B31,C39
`Chr7:4291038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B126,B23,B46,C78
`Chr7:4291048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C64
`Chr7:4291084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B31,B49,C39
`Chr7:4291107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:4291132`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	41	A10,A18,A7,B10,B103,B109,B112,B115,B117,B125,B135,B137,B20,B24,B27,B36,B60,B61,B67,B7,B72,B82,B90,B91,B92,C1,C12,C23,C3,C36,C40,C53,C57,C59,C63,C64,C68,C72,C73,C74,D8
`Chr7:4291133`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A10,A18,A7,B10,B103,B109,B112,B115,B117,B125,B135,B137,B20,B24,B27,B36,B60,B61,B67,B7,B72,B82,B90,B91,B92,C1,C12,C23,C3,C36,C4,C40,C53,C57,C59,C63,C68,C72,C73,C74,D8
`Chr7:4291193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C51
`Chr7:4291194`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B125,C71
`Chr7:4291194`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B125,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773792.1

757 aa

378

757

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 170-235 aa PF23559 WHD_DRP 313-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773792.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	170	235	1.7e-13	51.2	NB-ARC domain
`XP_057773792.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	313	381	4.1e-21	75.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917809.1
ATGGCTTACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTTGAAGGCATTCTGGATCCCAAACAAACACGCTGGATTCTTGGACGTAAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTCCCTGCAGCAGATTCTCGAAAAAACTCCACTCACCAAAATACCAAGCCTGGAGAGCCGAATCAGAGATGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATCATTGAATCTCACATGGTTGAACGAATGCTTTCGATTTATGAAAGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993085
ATGGCTTACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTTGAAGGCATTCTGGATCCCAAACAAACACGCTGGATTCTTGGACGTAAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTCCCTGCAGCAGATTCTCGAAAAAACTCCACTCACCAAAATACCAAGCCTGGAGAGCCGAATCAGAGATGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATCATTGAATCTCACATGGTTGAACGAATGCTTTCGATTTATGAAAGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773792.1
MAYNLQSLITILEGILDPKQTRWILGRKKPQLQSLLEKASSLQQILEKTPLTKIPSLESRIRDVANEAEDIIESHMVERMLSIYESVSFNLLTPDVLLVTQKLDSVIEQVVKLVEVETNKKPTGSSRSGASFSSSKSIVEGKTMPSGSSLSGASQLQDPSSKSVLVGVDEDLMQLKDRLTGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARKLYQDPSILEHFSYIAWVTISQDYEMRAILLGLIRCIIAGDCGGLPLAIHVVGGLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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