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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000638`

染色体: Chr07 坐标: 4300793-4302837 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000638`
名称	SmilChr07G000638
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4300793 - 4302837 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991839`
GeneID	`130991839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991839`
原始查询	`SmilChr07G000638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT1G16930` (AT1G16930) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838264] identity=32.9; qcov=0.493; evalue=1e-17; confidence=low
Rice	`Os11g0262500` (OsFbox597) - identity=30.2; qcov=0.565; evalue=6.96e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772235.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772235.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772235.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772235.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4300994`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98
`Chr7:4300994`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B98
`Chr7:4301000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C42
`Chr7:4301072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:4301094`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B18,B29,C86
`Chr7:4301094`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B18,B29,C86
`Chr7:4301138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C32
`Chr7:4301176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B21,B49
`Chr7:4301233`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B133,B21,B29,B49,C30,C55,C71,C86
`Chr7:4301250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C83
`Chr7:4301273`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B4,B8,B87,C12,C42,C52
`Chr7:4301281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B74,C17,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772235.1

469 aa

234

469

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 89-247 aa PF24758 LRR_At5g56370 111-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772235.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	89	247	1.5e-12	48.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772235.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	111	248	1.9e-11	44.8	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916252.1
TCTTTTTCTGCCCTTTCAGCAAATTCAAAGATAACATTTTTACCCCCATCGCAAGAACCCTAGCTCCTCCCCCGACTATCTTCTTAACTTCTTCTCCAATTAGACAAGAGTTCATTACAGATTTTAGAAAAAAAAATTTACTTCATTTCCCTGTTCCTTTGGAGAGTGAAGTCCTTTTCTCTTTCCTTCCTCACAATGGCTTCCTCGCACTTTCCTCGGATTTGTCTTTTCGAACATAACGATGTTTCCGACAGCTATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991839
ATGGCTTCCTCGCACTTTCCTCGGATTTGTCTTTTCGAACATAACGATGTTTCCGACAGCTATGCTCCCGACAGCTGCGATCGGCTGAGTGAGTTACCCGATTCCTTATTACTTTTGATTCTTTCGTTTTTGCGTTCGACGAGAGATGCTGTTAGGACAACGATTCTGTCCAAACGCTGGAAAGATCTGTGGACCACCGTCCCCTGCCTTGAGTTCAGAGACGAAAACCCAGAGTTTATTTATAGGGTTCTTGCACAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772235.1
MASSHFPRICLFEHNDVSDSYAPDSCDRLSELPDSLLLLILSFLRSTRDAVRTTILSKRWKDLWTTVPCLEFRDENPEFIYRVLAQWRGAKLLRFRLSLYWGVSSPTRGDLESWLLFAVEKQVEELHVDLGSDMPYYCPPQSLYSCSSVTALHLQNCSLEIEGSVQLNQLETLSIDAPASPWADAINKILLRAPRLENMSLSSVEIIDGNFNITSRSLKTLIIRHAKIKGVITISAPNLLTLQIHVDIYYGASFLCHVPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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