当前解析结果
SmilChr07G000651| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000651 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000651 |
| 描述 | CST complex subunit TEN1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 4388266 - 4390307 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991928 |
|---|---|
| GeneID | 130991928 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991928 |
| 原始查询 | SmilChr07G000651 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | CST complex subunit TEN1 |
| 产物 | CST complex subunit TEN1 |
| Arabidopsis | AT1G56260 (MDO1)telomere-capping, CST complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842079] identity=58.5; qcov=0.992; evalue=8.55e-45; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0010521 (telomerase inhibitor activity); GO:0032211 (negative regulation of telomere maintenance via telomerase); GO:0042162 (telomeric repeat DNA binding); GO:1990879 (CST complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF15490 (Ten1_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991928 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772368.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057772368.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057772368.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772368.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772368.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:4388479 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B122,B17,B40,B71 |
Chr7:4388504 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,B137 |
Chr7:4389506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr7:4389544 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B49,B79,C3,C35 |
Chr7:4389589 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C65,C84 |
Chr7:4389789 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr7:4389846 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B26,B85,D11 |
Chr7:4389887 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B63,B86,C12 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772368.1PF15490
Ten1_2 6-117 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772368.1 |
Pfam | PF15490 |
Ten1_2 | Domain | 6 | 117 | 2.3e-32 | 111.9 | Telomere-capping, CST complex subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。