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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000655`

染色体: Chr07 坐标: 4405150-4407086 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000655`
名称	SmilChr07G000655
描述	extensin-2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4405150 - 4407086 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991826`
GeneID	`130991826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991826`
原始查询	`SmilChr07G000655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-2-like
产物	extensin-2-like
Arabidopsis	`AT1G29100` (AT1G29100) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839785] identity=43.1; qcov=0.126; evalue=2.17e-12; confidence=weak
Rice	`Os01g0309800` (OJ1116_C07.8) - identity=52; qcov=0.149; evalue=1.1e-21; confidence=weak
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772218.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772218.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772218.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772218.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4405397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:4405418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:4405548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C1
`Chr7:4405615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:4405720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C2,C35
`Chr7:4405747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B127,B20,C37,C8
`Chr7:4405789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:4405790`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr7:4405790`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr7:4405799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C3
`Chr7:4405921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D6
`Chr7:4405931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B104,B26,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772218.1

516 aa

258

516

HMA

PF00403 HMA 47-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772218.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	47	100	2e-14	54.4	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916235.1
TCCAATTCCATGCAAGAAAATGCATGCCATATATTGATTCTCATTCCCTCAACACTGTGTCCATTCCCATACCATCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATTAATGGTCCCTGAAATGGAGAAACCTCAAGTCACAGAGATAAAGGTCAGAATGGATTGCAATGGCTGTGTGCAGAAAATCAAGAAAGCCCTGCAGGGAATCAACGGCATACACGACATCTGTGTCGATTTTCCGGAGCAGAAGCTAACCGTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991826
ATGCAAGAAAATGCATGCCATATATTGATTCTCATTCCCTCAACACTGTGTCCATTCCCATACCATCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATTAATGGTCCCTGAAATGGAGAAACCTCAAGTCACAGAGATAAAGGTCAGAATGGATTGCAATGGCTGTGTGCAGAAAATCAAGAAAGCCCTGCAGGGAATCAACGGCATACACGACATCTGTGTCGATTTTCCGGAGCAGAAGCTAACCGTTACCGGCTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772218.1
MQENACHILILIPSTLCPFPYHHLSLSLSLSPLMVPEMEKPQVTEIKVRMDCNGCVQKIKKALQGINGIHDICVDFPEQKLTVTGWAEPERLVKAIQKTRKSAVICVHTEQSDPPEGEGAPEEDVPPPETPPGPTNPPQTEAEAPDEPPPPTPPENPPPATRQPHQPTRPNDVEGVHVVYHHPPDNGYGGRWNAYHGGTGFRDEQHQPPPPAYVQSYNTYKPSPHLTDYAHLRPQPPRYSYDTRPDHYSGPELRGEPPQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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