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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000657`

染色体: Chr07 坐标: 4433907-4434359 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000657`
名称	SmilChr07G000657
描述	uncharacterized SmilChr07G000657
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4433907 - 4434359 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993088`
GeneID	`130993088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993088`
原始查询	`SmilChr07G000657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0286500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0286500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G54770` (ARP1) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824642] identity=82.8; qcov=0.427; evalue=3.57e-30; confidence=low
Rice	`Os03g0286500` - identity=70; qcov=0.533; evalue=4.95e-31; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773795.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773795.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057773795.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057773795.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4433921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:4433922`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A1,A16,A22,A24,B101,B103,B111,B113,B12,B122,B126,B129,B130,B137,B14,B140,B30,B38,B39,B43,B51,B55,B56,B6,B63,B67,B68,B73,B74,B76,B78,B80,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B96,C15,C17,C2,C21,C23,C24,C32,C36,C47,C54,C56,C63,C70,C77,C79,C8,C85,D10,D2,D4
`Chr7:4433943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr7:4433960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:4434036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C20
`Chr7:4434059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:4434076`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B43,B91
`Chr7:4434076`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B43,B91
`Chr7:4434093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C14
`Chr7:4434136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:4434296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C24
`Chr7:4434317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773795.1

150 aa

150

RRM_1

PF00076 RRM_1 2-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773795.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	2	43	8.4e-11	42.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917812.1
ATGAAAGACCACTTCGAAAAATACGGCGACATTCTCGAAGCCATCATCTCCGACAAGCTCACCGGCCGATCCAAGGGCTACGGCTTCATCACTTTCAAGGACGCCGATGCGGCCAAGAAAGCGTGCGAGGACCCCACTCCGATCATCAACGGCCGCCGCGCCAACTGCAACCTCGCCGGCCACGGCGGCTGTCACCACGACCAAGCCCGACCCCAACAAACTCCAATCCCTTCGCCAGCAACTGCTACCGCCGCACAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993088
ATGAAAGACCACTTCGAAAAATACGGCGACATTCTCGAAGCCATCATCTCCGACAAGCTCACCGGCCGATCCAAGGGCTACGGCTTCATCACTTTCAAGGACGCCGATGCGGCCAAGAAAGCGTGCGAGGACCCCACTCCGATCATCAACGGCCGCCGCGCCAACTGCAACCTCGCCGGCCACGGCGGCTGTCACCACGACCAAGCCCGACCCCAACAAACTCCAATCCCTTCGCCAGCAACTGCTACCGCCGCACAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773795.1
MKDHFEKYGDILEAIISDKLTGRSKGYGFITFKDADAAKKACEDPTPIINGRRANCNLAGHGGCHHDQARPQQTPIPSPATATAAQTPWFTVGAGVFMSPLPKPAADHLCRQQEFQQQRCSLPLNNLSKTKSPTLKMVRRTPSSAPESPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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