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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G000667

染色体: Chr07 坐标: 4514828-4528781 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G000667
名称SmilChr07G000667
描述(-)-5-epieremophilene synthase STPS2
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向4514828 - 4528781 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130991795
GeneID130991795
locus_tag-
NCBI NameLOC130991795
原始查询SmilChr07G000667

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述(-)-5-epieremophilene synthase STPS2
产物(-)-5-epieremophilene synthase STPS2
ArabidopsisAT5G23960 (TPS21)
terpene synthase 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832461]
identity=40.36; qcov=0.991; evalue=1.22e-140; confidence=medium
RiceOs08g0139700 (OsTPS29)
-
identity=37.8; qcov=0.974; evalue=2.29e-113; confidence=medium
GOGO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0010333 (terpene synthase activity); GO:0016102 (diterpenoid biosynthetic process)
KEGG-
PfamPF01397 (Terpene_synth); PF03936 (Terpene_synth_C); PF19086 (Terpene_syn_C_2)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130991795

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057772179.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057772179.1
3 Chloroplast 叶绿体 0.20000 XP_057772179.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:4515376 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B29
Chr7:4515396 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B140,C48,C82
Chr7:4515619 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 C3,C80,D7
Chr7:4515646 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B15,B86,C76
Chr7:4515687 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B91,D5
Chr7:4515846 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B44,B89
Chr7:4515849 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B66,C58
Chr7:4515874 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B118,C33,C46
Chr7:4515912 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A2,B56,C45,C83
Chr7:4515915 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A2,B56,C45,C83
Chr7:4515936 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B121,B26,B45,B64
Chr7:4516218 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B109,B126,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772179.1
546 aa
N
1
273
546
Terpene_synth
Terpene_synth_C
Terpene_syn_C_2
C
PF01397 Terpene_synth 19-193 aa PF03936 Terpene_synth_C 250-488 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 290-488 aa
XP_057772180.1
546 aa
N
1
273
546
Terpene_synth
Terpene_synth_C
Terpene_syn_C_2
C
PF01397 Terpene_synth 19-193 aa PF03936 Terpene_synth_C 250-488 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 290-488 aa
XP_057772181.1
546 aa
N
1
273
546
Terpene_synth
Terpene_synth_C
Terpene_syn_C_2
C
PF01397 Terpene_synth 19-193 aa PF03936 Terpene_synth_C 250-488 aa PF19086 Terpene_syn_C_2 290-488 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057772179.1 Pfam PF01397 Terpene_synth Repeat 19 193 2.9e-54 184.4 Terpene synthase, N-terminal domain
XP_057772179.1 Pfam PF03936 Terpene_synth_C Domain 250 488 1.8e-90 303.2 Terpene synthase family, metal binding domain
XP_057772179.1 Pfam PF19086 Terpene_syn_C_2 Domain 290 488 2.5e-47 161.9 Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding
XP_057772180.1 Pfam PF01397 Terpene_synth Repeat 19 193 1.7e-54 185.1 Terpene synthase, N-terminal domain
XP_057772180.1 Pfam PF03936 Terpene_synth_C Domain 250 488 1.8e-90 303.2 Terpene synthase family, metal binding domain
XP_057772180.1 Pfam PF19086 Terpene_syn_C_2 Domain 290 488 2.5e-47 161.9 Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding
XP_057772181.1 Pfam PF01397 Terpene_synth Repeat 19 193 1.3e-55 188.7 Terpene synthase, N-terminal domain
XP_057772181.1 Pfam PF03936 Terpene_synth_C Domain 250 488 3.2e-90 302.4 Terpene synthase family, metal binding domain
XP_057772181.1 Pfam PF19086 Terpene_syn_C_2 Domain 290 488 2.3e-47 162.1 Terpene synthase family 2, C-terminal metal binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XM_057916198.1
CCTAATAGTCGTAGCTAAAGCAATAGCCAAAGTCGGCTCCCGCAAGAAGCTGAAATTTCTGACCCACCCACTGCTGTTTTAACTAATATAAATAGGGCTCTGCAGCCCTTCATTCTTCACTGCAAAATTAATCAGCTTCTGCTTTGAGCTCTTTGCAATACTTAGCCCCCCAAAAAAAAAGTTTCCCAAATTCTCATACAAAAATGGCTGCCGCACAAGCAGAAATTCAGAGGCCGATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTG...
XM_057916197.1
CATTCTTCACTGCAAAATTAATCAGCTTCTGCTTTGAGCTCTTTGCAATACTTAGCCCCCCAAAAAAAAAGTTTCCCAAATTCTCATACAAAAATGGCTGCCGCACAAGCAGAAATTCAGAGGCCGATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTGTGGGGCGATCAGTTCATCAAGAATGATTCTGATGCTAAGGCTGCGGAGAAACATTGCAAGGCAGTTGAAGAGTTGAAGAAGGAAGTTATGAATATGATAACTGCTGGTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057772180.1_35235
ATGGCTGCCGCACAAGCAGAAATTCAGAGGCCGATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTGTGGGGCGATCAGTTCATCAAGAATGATTCTGATGCTAAGGCTGCGGAGAAACATTGCAAGGCAGTTGAAGAGTTGAAGAAGGAAGTTATGAATATGATAACTGCTGGTGGAAGCAATCTTGTTGAAGCGATGAACCTTATTGACACACTCGAACGCCTTGGCATTTCTTATCACTTTGAAAAGGAGATTGACCAAAAATTGAA...
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057772181.1_35236
ATGGCTGCCGCACAAGCAGAAATTCAGAGGCCGATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTGTGGGGCGATCAGTTCATCAAGAATGATTCTGATGCTAAGGCTGCGGAGAAACATTTCAAGGCAGTTGAAGAGTTGAAGAAGGAAGTTATGAATATGATAACTGCTGCTGAAAGCAATCTTGTTGAATCCATGAACCTTATTGACACACTTGAACGCCTTGGCATTTCTTATCACTTTGAAAAGGAGATTGACCAAAAATTGCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057772179.1
MATTQAEIQRPIANFSPSLWGDQFIKNDSGAKAAEKHCKAVEELKKEVMNMITAGGSNLVEAMNLIDTLERLGISYHFEKEIDQKLNHFFNLNTDYSDESYDLYTVSLHFRLFRQHGHRISSDIFGRWIDESGKFKEGLKTDGKGLLSLYEASYLRTRGETILDDALEFATATLNSIAPHLESPLSKQVVHALIQPLHYGNPRIEAHNFISIYEENQDKNEFLLKFAKLDYNLLQMLHKEELHEVSRWWKELDLVSKLPY...
XP_057772180.1
MAAAQAEIQRPIANFSPSLWGDQFIKNDSDAKAAEKHCKAVEELKKEVMNMITAGGSNLVEAMNLIDTLERLGISYHFEKEIDQKLNHFFNLNTDYSDESYDLYTVSLHFRLFRQHGHRISSDIFGRWIDESGKFKEGLKTDGKGLLSLYEASYLRTRGETILDDALEFATATLNSIAPHLESPLSKQVVHALIQPLHYGNPRIEAHNFISIYEENQDKNEFLLKFAKLDYNLLQMLHKEELHEVSRWWKELDLVSKLPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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