Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000691`

染色体: Chr07 坐标: 4724621-4725146 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000691`
名称	SmilChr07G000691
描述	S-protein homolog 29-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4724621 - 4725146 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993095`
GeneID	`130993095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993095`
原始查询	`SmilChr07G000691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-protein homolog 29-like
产物	S-protein homolog 29-like
Arabidopsis	`AT5G12070` (AT5G12070) Plant self-incompatibility protein S1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831080] identity=37.37; qcov=0.772; evalue=2.18e-12; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05938 (Self-incomp_S1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993095

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057773801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4724865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B21,B37,B39,D10
`Chr7:4724913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:4725063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B26,B45,B64
`Chr7:4725129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B118,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773801.1

127 aa

127

Self-incomp_S1

PF05938 Self-incomp_S1 34-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773801.1`	Pfam	`PF05938`	Self-incomp_S1	Family	34	118	8.6e-23	81.6	Plant self-incompatibility protein S1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917818.1
ATGAGCCATTTCAAGCACTCTCTCGCCCTAATAATCGCGATCTACATCGCGTTTTTGGGGTCATCAAGAGCTAGCGGCATTGGGATATTCCAAAGCTACGAAGTTCACATGATCAACAACATCGTGAACAGCACAGATGAGCTGCTCGTCAGCTGCAAATCTGCAGATGATGATCTGGGAGAGCATTTCTTGGATAATGGCGATGATTGGAGTTGGAAATTTAGGGTTAATTTCTTCAGATCAACTCTGTTTTTCTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057773801.1_35258
ATGAGCCATTTCAAGCACTCTCTCGCCCTAATAATCGCGATCTACATCGCGTTTTTGGGGTCATCAAGAGCTAGCGGCATTGGGATATTCCAAAGCTACGAAGTTCACATGATCAACAACATCGTGAACAGCACAGATGAGCTGCTCGTCAGCTGCAAATCTGCAGATGATGATCTGGGAGAGCATTTCTTGGATAATGGCGATGATTGGAGTTGGAAATTTAGGGTTAATTTCTTCAGATCAACTCTGTTTTTCTGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773801.1
MSHFKHSLALIIAIYIAFLGSSRASGIGIFQSYEVHMINNIVNSTDELLVSCKSADDDLGEHFLDNGDDWSWKFRVNFFRSTLFFCHLQWGDLRKRFNAFDTDNISYQCEETSTCFWSYLIVKNNAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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