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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000692`

染色体: Chr07 坐标: 4729254-4750130 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000692`
名称	SmilChr07G000692
描述	uncharacterized SmilChr07G000692
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4729254 - 4750130 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991882`
GeneID	`130991882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991882`
原始查询	`SmilChr07G000692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox345; symbol=OsFbox345; hit=Os07g0170800; species=rice; confidence=high
产物	OsFbox345; symbol=OsFbox345; hit=Os07g0170800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os07g0170800` (OsFbox345) - identity=63; qcov=0.86; evalue=5.84e-68; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772307.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772309.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772310.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057772311.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4729833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B129
`Chr7:4729939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B52,B98,C55
`Chr7:4733384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	137	A10,A13,A18,A19,A2,A21,A22,A25,A5,B1,B10,B100,B105,B106,B11,B115,B117,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B131,B132,B139,B14,B15,B17,B2,B20,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B45,B47,B49,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B59,B61,B63,B64,B66,B67,B7,B71,B74,B75,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B97,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C29,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C40,C42,C43,C46,C49,C51,C56,C58,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C69,C71,C72,C74,C77,C78,C81,C82,C87,C9,D11,D2,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:4733473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr7:4733558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:4749610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C83
`Chr7:4749669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C64,C66
`Chr7:4749753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C32,C68
`Chr7:4749825`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A23,A8,B11,B122,B53,B62,B63,B72,B86,B9,C12,C47,C58,C83,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772307.1

285 aa

142

285

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 73-108 aa PF12937 F-box-like 74-112 aa

XP_057772308.1

266 aa

133

266

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 73-108 aa PF12937 F-box-like 74-112 aa

XP_057772309.1

242 aa

121

242

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 73-108 aa PF12937 F-box-like 74-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772307.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	73	108	7.2e-06	26.4	F-box domain
`XP_057772307.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	74	112	4.9e-08	33.3	F-box-like
`XP_057772308.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	73	108	7e-06	26.5	F-box domain
`XP_057772308.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	74	112	4.8e-08	33.4	F-box-like
`XP_057772309.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	73	108	4e-06	27.2	F-box domain
`XP_057772309.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	74	112	7.8e-08	32.7	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916324.1
CGAGTCCAACACGTGGGGCTCGGTGAGGCTGCATGAGATAAAACCCCATGTCAGGTTAGCCTCCTTTCTCTCTCTAAAACCCAGTAATATCGTAATTTCTCCCCTTTTCAAATGTGATCCTCTGCGGCCATAAACCCTTGCGGGGCGTGGGTTCGGACACGTCACCACCTCCCATTTGCATCGACGTCGACAACTGATTTTTGCCTCACTACGTTTCGCCCATTTCATAGTTCCCACGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTA...

XM_057916325.1
AGTCCAACACGTGGGGCTCGGTGAGGCTGCATGAGATAAAACCCCATGTCAGGTTAGCCTCCTTTCTCTCTCTAAAACCCAGTAATATCGTAATTTCTCCCCTTTTCAAATGTGATCCTCTGCGGCCATAAACCCTTGCGGGGCGTGGGTTCGGACACGTCACCACCTCCCATTTGCATCGACGTCGACAACTGATTTTTGCCTCACTACGTTTCGCCCATTTCATAGTTCCCACGTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTATA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130991882
ATGTTCCATGCTCCCTTTCTCTCTGCACAATTCGTTCACCTGATTGGGGCATTGGAAAAAGTTAGTGCTCTCTTTCGTTTTCCGTCTTCTCAATCGGTTATGTCGGAGTCCGGGGGTGAAGAATCGGGCAAGCAAGGTAAGCGGAAGGCCAAGGCCGATGATTCGGGCGGGGAGGAGCTTCAGTTGGCGGCGGAGGACCCCTTGCTGGTGTTCGGTTCGGAAATCATGACGATAATTCTGAGCAAGCTCGACGTGCGCAG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057772307.1
MFHAPFLSAQFVHLIGALEKVSALFRFPSSQSVMSESGGEESGKQGKRKAKADDSGGEELQLAAEDPLLVFGSEIMTIILSKLDVRSLAEARLVSRGWQAVASSDRIWAPKCQELWLDKAHIPRVSMAEGLPKIVATLLSIRDGKRTRITRDDLCDHVWEFRFTELAPEYWRDLDPSWRSGGGAPMRRYFHPDGSITADPEDKVWGGHESSYTIVTGVLADGKVREHYVRINRWPKMMVERNPDWSWELRNHLYCYRSIP...

XP_057772308.1
MFHAPFLSAQFVHLIGALEKVSALFRFPSSQSVMSESGGEESGKQGKRKAKADDSGGEELQLAAEDPLLVFGSEIMTIILSKLDVRSLAEARLVSRGWQAVASSDRIWAPKCQELWLDKAHIPRVSMAEGLPKIVATLLSIRDGKRLAPEYWRDLDPSWRSGGGAPMRRYFHPDGSITADPEDKVWGGHESSYTIVTGVLADGKVREHYVRINRWPKMMVERNPDWSWELRNHLYCYRSIPDADGRRGSASSGSISISIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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